55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0344 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0344  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  488  1e-137  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000148498  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  49.18 
 
 
245 aa  227  1e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1285  hypothetical protein  43.85 
 
 
248 aa  192  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000650054  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  41.7 
 
 
245 aa  184  9e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  41.3 
 
 
246 aa  182  3e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  41.3 
 
 
246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  40.89 
 
 
246 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  39.75 
 
 
247 aa  180  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  40.98 
 
 
246 aa  180  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  26.84 
 
 
246 aa  89  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  25.82 
 
 
248 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  23.5 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  24.88 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  24.41 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  25.59 
 
 
247 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  25.12 
 
 
248 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  27.12 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  25.12 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  22.66 
 
 
252 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  23.24 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  25.12 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  25.12 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  25.12 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0956  protein of unknown function DUF328  27.71 
 
 
232 aa  57  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  22.94 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  23.45 
 
 
246 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11743  predicted protein  29.93 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.555211  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  24.64 
 
 
251 aa  52.4  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  26.26 
 
 
259 aa  52  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4102  hypothetical protein  26.59 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  21.49 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  24.55 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  27.85 
 
 
258 aa  49.7  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0026  hypothetical protein  26.62 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.234225  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0519  protein of unknown function DUF328  25.74 
 
 
240 aa  48.9  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1358  hypothetical protein  25.97 
 
 
257 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  23.35 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  29.94 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  25.5 
 
 
265 aa  47  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0016  hypothetical protein  24.07 
 
 
257 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  23.11 
 
 
254 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  28.48 
 
 
258 aa  45.8  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  29.68 
 
 
260 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0239  hypothetical protein  25.95 
 
 
251 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000011533  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1244  hypothetical protein  26.8 
 
 
259 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  25.36 
 
 
249 aa  45.4  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  26.82 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0604  protein of unknown function DUF328  25.65 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0200357  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0493  hypothetical protein  27.06 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000635683  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1764  hypothetical protein  30.19 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0121246 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1568  hypothetical protein  27.95 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1320  hypothetical protein  26.99 
 
 
254 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  25.79 
 
 
289 aa  42.4  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2547  hypothetical protein  23.57 
 
 
259 aa  42.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  27.08 
 
 
257 aa  42  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>