More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3669 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3669  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  100 
 
 		 265 aa  512  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4045  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  88.26 
 
 		 269 aa  450  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344042  normal  0.123945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3490  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  57.03 
 
 		 278 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2596  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  54.37 
 
 		 278 aa  244  8e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0374666  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0508  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  54.86 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4551  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  50.79 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.357985 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2264  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  52.9 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627162 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0389  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  38.52 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317116  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  40.08 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6125  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  36.7 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426538  hitchhiker  0.00598372 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0528  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  39.05 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2586  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  32.8 
 
 		 331 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.970402  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  32.13 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17860  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  38.38 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  29.57 
 
 		 291 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  30.31 
 
 		 290 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0285  dimethyladenosine transferase  29.93 
 
 		 302 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1867  dimethyladenosine transferase  28.08 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  27.31 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  28.91 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  30.46 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  28.36 
 
 		 285 aa  89  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  28.29 
 
 		 291 aa  89  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  34.18 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  23.89 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42375  predicted protein  34.38 
 
 		 320 aa  85.9  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  29.81 
 
 		 288 aa  85.9  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  34.03 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  25.82 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  31.43 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  33.51 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  30.5 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  28.14 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  33.78 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  31.79 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  27.7 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  28.09 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  35.52 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  25.6 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  25.47 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  27.97 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  31.75 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  27.23 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  33.16 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  33.68 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  27.23 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  31.44 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  27.23 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  27.23 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  27.23 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  27.23 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  27.23 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  27.23 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  27.23 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  27.23 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  26.98 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  27.72 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  27.14 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  32.2 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  25.93 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  25.93 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  32.83 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  29.6 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  25.68 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  26.4 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  29.3 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  30 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  26.77 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75487  Dimethyladenosine transferase (S-adenosylmethionine-6-N', N'-adenosyl(rRNA) dimethyltransferase) (18S rRNA dimethylase)  32.07 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.368235 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  31.28 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  28.42 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  28.22 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf007  dimethyladenosine transferase  29.57 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  32.98 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  25.19 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  21.2 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  24.79 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  26.39 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  29.38 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  29.9 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2090  dimethyladenosine transferase  22.35 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  28.65 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  29.38 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  26.75 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  31.51 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  23.02 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  26.72 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  26.72 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  27 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  26.02 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  26.72 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  28.49 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  30.55 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  24.73 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  28.4 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  26.04 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  25.35 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0791  dimethyladenosine transferase  31.63 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000779511  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  27.45 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>