More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3644 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3644  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 362 aa  727    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4026  peptide chain release factor 1  95.3 
 
 		 362 aa  619  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1304  peptide chain release factor 1  72.5 
 
 		 367 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6150  peptide chain release factor 1  70.37 
 
 		 354 aa  491  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.749977  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  69.36 
 
 		 356 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1751  peptide chain release factor 1  69.57 
 
 		 357 aa  477  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1656  peptide chain release factor 1  69.08 
 
 		 350 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2419  peptide chain release factor 1  68.77 
 
 		 355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.922635  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29910  peptide chain release factor 1  69.49 
 
 		 358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363268 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0324  peptide chain release factor 1  67.62 
 
 		 356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0888  peptide chain release factor 1  71.06 
 
 		 350 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4148  peptide chain release factor 1  69.97 
 
 		 363 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3931  peptide chain release factor 1  70.61 
 
 		 361 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2101  peptide chain release factor 1  69.54 
 
 		 361 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015284  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0641  peptide chain release factor 1  71.43 
 
 		 364 aa  450  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11326  peptide chain release factor 1  64.74 
 
 		 357 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3961  peptide chain release factor 1  64.74 
 
 		 357 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3873  peptide chain release factor 1  64.74 
 
 		 357 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3887  peptide chain release factor 1  64.74 
 
 		 357 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3720  peptide chain release factor 1  67.17 
 
 		 357 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2352  peptide chain release factor 1  62.68 
 
 		 357 aa  435  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000547652 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1286  peptide chain release factor 1  67.72 
 
 		 373 aa  432  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.258232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2619  peptide chain release factor 1  62.39 
 
 		 357 aa  431  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254824  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2459  peptide chain release factor 1  66.3 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4339  peptide chain release factor 1  63.01 
 
 		 357 aa  424  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776399 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1236  peptide chain release factor 1  64.08 
 
 		 362 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.417509  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1010  peptide chain release factor 1  64.18 
 
 		 356 aa  424  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1785  peptide chain release factor 1  65.18 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2307  peptide chain release factor 1  64.29 
 
 		 357 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1909  peptide chain release factor 1  65.32 
 
 		 364 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150349  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1086  peptide chain release factor 1  57.71 
 
 		 365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1889  peptide chain release factor 1  58.57 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.640153  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09920  peptide chain release factor 1  64.74 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1257  peptide chain release factor 1  68.95 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626202  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1061  peptide chain release factor 1  68.91 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.742793  normal  0.892078 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08070  peptide chain release factor 1  61.8 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19240  peptide chain release factor 1  60.56 
 
 		 378 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 		 356 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18340  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 		 357 aa  362  6e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  52.25 
 
 		 356 aa  361  9e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 		 353 aa  359  4e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  52.79 
 
 		 355 aa  358  6e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  50.87 
 
 		 357 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  51.44 
 
 		 355 aa  352  5e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  52.25 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  47.41 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  47.41 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  52.17 
 
 		 357 aa  346  4e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1652  peptide chain release factor 1  52.85 
 
 		 364 aa  345  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.534857  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  51.52 
 
 		 359 aa  343  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08900  peptide chain release factor 1  51.25 
 
 		 357 aa  343  2e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000087001  normal  0.899711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1891  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 352 aa  343  4e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.000000000024235 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1808  peptide chain release factor 1  53.48 
 
 		 357 aa  341  1e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  48.56 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  49.59 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 355 aa  339  2.9999999999999998e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  53.09 
 
 		 355 aa  338  7e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  46.87 
 
 		 358 aa  338  9e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 356 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  47.47 
 
 		 358 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  51.44 
 
 		 355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  48.9 
 
 		 361 aa  335  5.999999999999999e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  48.9 
 
 		 361 aa  335  5.999999999999999e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  54.91 
 
 		 354 aa  335  9e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 355 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 358 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 358 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 358 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  50.6 
 
 		 355 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 358 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 355 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 358 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 358 aa  333  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  46.61 
 
 		 359 aa  332  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  48.46 
 
 		 355 aa  332  5e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 351 aa  332  5e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 358 aa  332  6e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  48.03 
 
 		 358 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14260  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 		 352 aa  331  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.210236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  48.35 
 
 		 361 aa  331  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  46.67 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  52.34 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  46.63 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0836  peptide chain release factor 1  46.94 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 360 aa  329  4e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  50.87 
 
 		 355 aa  328  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  47.9 
 
 		 355 aa  328  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  48.82 
 
 		 363 aa  327  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  50.6 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  51.16 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  49.28 
 
 		 370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  49.28 
 
 		 370 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  47.32 
 
 		 356 aa  326  3e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 370 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  47.19 
 
 		 362 aa  326  3e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 372 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>