More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3238 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  100 
 
 		 256 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  89.16 
 
 		 249 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  57.44 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  56.72 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  53.65 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  50 
 
 		 252 aa  178  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  52.82 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  48.95 
 
 		 245 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  51.04 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  56.65 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  45.83 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  51.17 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  48.51 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  53.55 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  50.63 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25080  methyltransferase family protein  46.83 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.779034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  30.52 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  30.52 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  30.52 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  30.52 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  30.52 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  32.39 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.05 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  31.05 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  31.05 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  31.05 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  31.05 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  31.05 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  31.05 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  31.05 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  30.65 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  31.2 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  29.8 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  31.35 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  27.2 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  33.77 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  29.54 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  31.4 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  38.5 
 
 		 269 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  25.51 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  26.36 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  25.98 
 
 		 271 aa  86.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  27.39 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  32.86 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  27.07 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  32.87 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  28.81 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  28.81 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  29 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  29 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  28.81 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  32.95 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  25 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  27 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  27.39 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  25.31 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  32.09 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  31.63 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  26.07 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  26.42 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.93 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  34.87 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.33 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  26.32 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  35.34 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  30.34 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  32.61 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  32.07 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  31.52 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  29.69 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.39 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.6 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0179  hypothetical protein  22.54 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.34 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.71 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  28.12 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  42.86 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.48 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.22 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  37.3 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.39 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 335 aa  55.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.34 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.74 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.95 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  44 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>