More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2885 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2885  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 462 aa  904    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  98.25 
 
 		 457 aa  876    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.71 
 
 		 491 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.449609  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0344  signal transduction histidine kinase  46.03 
 
 		 479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  36.28 
 
 		 471 aa  203  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  39.03 
 
 		 524 aa  193  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 482 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  37.8 
 
 		 472 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 478 aa  181  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.67 
 
 		 464 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 675 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 523 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2631  histidine kinase  39.6 
 
 		 529 aa  177  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  35.64 
 
 		 566 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  38.72 
 
 		 542 aa  176  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 449 aa  176  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  34.04 
 
 		 498 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1156  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 526 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0467  histidine kinase  46.12 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.928659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 543 aa  170  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0613  histidine kinase  36.2 
 
 		 476 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 482 aa  159  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11000  two component system sensor kinase mprB  31.84 
 
 		 504 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000433123  normal  0.966501 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 515 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4300  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 515 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 515 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 484 aa  153  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  31.96 
 
 		 486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  36.75 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  30.3 
 
 		 490 aa  136  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 469 aa  130  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 457 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 474 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 446 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  28.3 
 
 		 481 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  24.8 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  32.06 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  34.68 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  24.52 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  24.52 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 466 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 446 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  33.55 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.85 
 
 		 370 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  33.23 
 
 		 466 aa  121  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  32.89 
 
 		 450 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 469 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 		 477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.9 
 
 		 448 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  37.17 
 
 		 413 aa  119  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  26.69 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 524 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 538 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 607 aa  118  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.21 
 
 		 466 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  33.92 
 
 		 470 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  29.63 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  34.5 
 
 		 450 aa  118  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  30.43 
 
 		 481 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  23.2 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 465 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  32.43 
 
 		 436 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  29.38 
 
 		 481 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 438 aa  116  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 362 aa  116  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 601 aa  116  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  35.53 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  28.88 
 
 		 475 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  31.1 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  31.1 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  31.1 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  25.95 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  29.04 
 
 		 458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3007  histidine kinase  32.52 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  34.01 
 
 		 467 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  26.75 
 
 		 472 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 601 aa  113  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  24.53 
 
 		 458 aa  113  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  26.21 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.6 
 
 		 512 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  31.62 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  29.27 
 
 		 469 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  28.42 
 
 		 508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>