223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0987 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  390  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  91.33 
 
 
196 aa  360  9e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  63.08 
 
 
196 aa  240  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  47.87 
 
 
208 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  49.21 
 
 
193 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  46.56 
 
 
198 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  48.65 
 
 
192 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  50.27 
 
 
191 aa  157  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  47.51 
 
 
198 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  46.32 
 
 
198 aa  152  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  43.32 
 
 
201 aa  151  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  43.85 
 
 
204 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  43.85 
 
 
204 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  43.85 
 
 
204 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  43.96 
 
 
204 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  43.85 
 
 
202 aa  148  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  45.5 
 
 
193 aa  148  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  45.65 
 
 
184 aa  145  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  42.86 
 
 
209 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  44.27 
 
 
192 aa  141  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  45.05 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  45.99 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  45.74 
 
 
191 aa  137  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  38.12 
 
 
225 aa  127  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  40.22 
 
 
187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  40.44 
 
 
182 aa  123  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  41.85 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  32.64 
 
 
182 aa  105  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  34.95 
 
 
189 aa  99  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  32.79 
 
 
187 aa  98.6  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  34.22 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  34.92 
 
 
187 aa  95.9  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  36.07 
 
 
184 aa  95.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  31.96 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  34.54 
 
 
184 aa  91.3  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  31.18 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  32.79 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  34.88 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  32.97 
 
 
187 aa  86.3  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  29.51 
 
 
190 aa  85.1  5e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  30.53 
 
 
187 aa  84.3  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  30.6 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  33.9 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  33.77 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  29.31 
 
 
186 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  36.02 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  29.84 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  33.71 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  33.7 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  32.56 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  32.43 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  33.14 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  31.49 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  32.43 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  30.23 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  28.14 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  32.7 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  30.73 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  29.44 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  28.49 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  32.47 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  26.49 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  32.08 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  32.03 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  32.03 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  28.73 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3962  hypothetical protein  36.02 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  30.9 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  35.29 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  30.9 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  32.3 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  31.37 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  32.14 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  35.67 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  30.9 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  32.77 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  32.77 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  32.77 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  35.03 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  30.9 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  30.77 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  31.61 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  31.98 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1764  protein of unknown function DUF179  28.87 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.619647  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  32.4 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4073  protein of unknown function DUF179  36.41 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.424244  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4106  protein of unknown function DUF179  36.41 
 
 
197 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  31.74 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  32.2 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  29.41 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  30.64 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  26.46 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0457  hypothetical protein  34.41 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  30.29 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  26.14 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  30.6 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  34 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  29.94 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  34 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>