More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0435 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0435  ABC transporter related  100 
 
 		 453 aa  896    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2289  ABC transporter related protein  55.17 
 
 		 391 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1887  ABC transporter-like protein  51.16 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1737  ABC transporter related protein  53.23 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3350  ABC-type sugar transport systems ATPase components-like protein  51.27 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  46.48 
 
 		 406 aa  318  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  48.36 
 
 		 370 aa  316  5e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  53.16 
 
 		 363 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  43.48 
 
 		 363 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  47.65 
 
 		 380 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  54.89 
 
 		 356 aa  309  9e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  46.54 
 
 		 408 aa  307  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  47.94 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  45.43 
 
 		 370 aa  306  6e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  43.58 
 
 		 369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  43.58 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  47.04 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  47.78 
 
 		 426 aa  303  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  48.63 
 
 		 388 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2849  ABC transporter-related protein  48.48 
 
 		 377 aa  302  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  48.81 
 
 		 370 aa  302  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  47.79 
 
 		 381 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 370 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  49.4 
 
 		 409 aa  300  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 364 aa  300  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  47.22 
 
 		 364 aa  300  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.99 
 
 		 369 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  46.32 
 
 		 374 aa  300  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  47.22 
 
 		 364 aa  300  4e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  51.71 
 
 		 398 aa  300  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  45.05 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  45.05 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  46.91 
 
 		 364 aa  298  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1050  ABC transporter related  46.91 
 
 		 356 aa  297  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  44.44 
 
 		 372 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  46.57 
 
 		 392 aa  296  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  42.49 
 
 		 366 aa  296  4e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  44.48 
 
 		 371 aa  296  6e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  47.58 
 
 		 380 aa  296  8e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 370 aa  295  9e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  50.83 
 
 		 360 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  50.87 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  51.68 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  47.69 
 
 		 375 aa  294  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  40.47 
 
 		 409 aa  295  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  47.46 
 
 		 368 aa  293  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.33 
 
 		 369 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  49.16 
 
 		 404 aa  294  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  44.38 
 
 		 370 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 425 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  46.49 
 
 		 399 aa  293  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  43.62 
 
 		 372 aa  293  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  45.22 
 
 		 388 aa  293  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  46.07 
 
 		 389 aa  293  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  50.67 
 
 		 363 aa  292  8e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  50.69 
 
 		 405 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  50.69 
 
 		 405 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  50 
 
 		 393 aa  292  9e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  50.69 
 
 		 405 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  44.64 
 
 		 585 aa  292  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.36 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  47.59 
 
 		 367 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  47.59 
 
 		 367 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  47.59 
 
 		 367 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  46.33 
 
 		 365 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  51.57 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  46.63 
 
 		 375 aa  291  2e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  49.83 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.13 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  45.63 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  45.98 
 
 		 398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  48.12 
 
 		 355 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4499  ABC transporter related protein  50.86 
 
 		 381 aa  290  5.0000000000000004e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0578082  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  46.53 
 
 		 359 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  47.62 
 
 		 373 aa  289  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  45.21 
 
 		 355 aa  289  6e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  58.02 
 
 		 375 aa  289  7e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  55.02 
 
 		 361 aa  289  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.35 
 
 		 357 aa  289  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  46.53 
 
 		 357 aa  289  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.68 
 
 		 366 aa  289  8e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.68 
 
 		 366 aa  289  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9197  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.56 
 
 		 359 aa  289  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  45.67 
 
 		 398 aa  289  9e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  51.02 
 
 		 375 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  43.82 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.44 
 
 		 372 aa  288  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  45.04 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  44.91 
 
 		 355 aa  288  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  48.48 
 
 		 359 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.68 
 
 		 360 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  42.65 
 
 		 378 aa  287  2.9999999999999996e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  44.39 
 
 		 391 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  49.31 
 
 		 366 aa  287  2.9999999999999996e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.79 
 
 		 366 aa  286  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  49.5 
 
 		 371 aa  286  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  44.48 
 
 		 381 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.38 
 
 		 366 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.38 
 
 		 366 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>