More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_4140 on replicon NC_013518
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013518  Sterm_4140  Resolvase domain protein  100 
 
 
217 aa  437  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00204948  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  33.33 
 
 
200 aa  95.9  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0049  recombinase  33.49 
 
 
220 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00880033  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  28.44 
 
 
190 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0065  DNA recombinase  33.96 
 
 
203 aa  85.1  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  31.37 
 
 
197 aa  84.7  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  32.88 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  33.66 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  32.52 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1183  resolvase domain-containing protein  32.7 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.132915  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  30.66 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2438  Resolvase domain protein  34.58 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000895592 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  27.27 
 
 
189 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  30.88 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  37.74 
 
 
186 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  32.84 
 
 
184 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  37.11 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  31.65 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  37.74 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  37.74 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  33.13 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  32.37 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  33.33 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  29.95 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  44.94 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  33.95 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  33.95 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  32.84 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  31.63 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  34.16 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  31.63 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  33.33 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  33.33 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  33.17 
 
 
185 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  31.63 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  33.33 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  33.17 
 
 
185 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  33.17 
 
 
185 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  33.17 
 
 
185 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  32.54 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  33.17 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  29.95 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0216  site-specific recombinase  29.41 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.613104 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  28.78 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  34.36 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  28.43 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  31.67 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  35.4 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  35.4 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  32.68 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  35.22 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  30.7 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  35.22 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0167  site-specific recombinase  34.57 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  30.18 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  33.74 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  34.36 
 
 
201 aa  72  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  29.61 
 
 
192 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  33 
 
 
186 aa  72  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  28.16 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  31.22 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  36.48 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  31.22 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  30.73 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  30.73 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  31.37 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  33.5 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  36.65 
 
 
184 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  30.24 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  31.5 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  29.35 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.44 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  30.9 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  32.34 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  32.16 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  32.2 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  25.37 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  32.72 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  33.01 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  31.37 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  30.65 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  31.68 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  29.85 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  28.02 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  31.06 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  36.02 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  33.74 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  29.85 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  29.85 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  32.52 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  30 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  30 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  31.66 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  30.5 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  28.9 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  28.91 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>