44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2883 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  74.18 
 
 		 276 aa  423  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  56.88 
 
 		 280 aa  335  5.999999999999999e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  54.87 
 
 		 276 aa  321  8e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  54.71 
 
 		 283 aa  320  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  53.99 
 
 		 275 aa  315  7e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  52 
 
 		 279 aa  304  1.0000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  38.24 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  36.46 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  34.19 
 
 		 291 aa  165  8e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.32 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  34.89 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  34.64 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  31.18 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.16 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  34.17 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  31.39 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  31.34 
 
 		 292 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  33.81 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  33.09 
 
 		 273 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.96 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  29.54 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  30.24 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  32.14 
 
 		 272 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  31.79 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.84 
 
 		 334 aa  118  9e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  30.26 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.21 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  29.51 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  27.22 
 
 		 279 aa  49.3  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  25.32 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  26.53 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  23.87 
 
 		 276 aa  45.8  0.0007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  24.33 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  26.59 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  32.77 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1147  endonuclease IV  26.24 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0264  apurinic endonuclease Apn1  27.65 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  24.21 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  23.53 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  24.21 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  24.21 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  28.36 
 
 		 286 aa  42.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  23.04 
 
 		 269 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>