More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2035 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2035  glycine cleavage H-protein  100 
 
 		 148 aa  297  4e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1481  glycine cleavage system protein H  79.05 
 
 		 148 aa  235  2e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.14622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1076  glycine cleavage system protein H  49.32 
 
 		 158 aa  146  8e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510975  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1073  glycine cleavage system protein H  43.54 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237871  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2869  glycine cleavage system H protein, putative  43.66 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2490  glycine cleavage H-protein  43.66 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0973  glycine cleavage H-protein  41.84 
 
 		 144 aa  123  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.714694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3134  glycine cleavage H-protein  39.16 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1746  glycine cleavage H-protein  38.19 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.342973  normal  0.262336 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  43.8 
 
 		 138 aa  117  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0638  glycine cleavage H-protein  37.24 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0640  glycine cleavage H-protein  44.62 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2208  glycine cleavage H-protein  41.01 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2210  glycine cleavage H-protein  35.17 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00775002  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0974  glycine cleavage H-protein  35.42 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357877  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2547  glycine cleavage system H protein, putative  37.41 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2175  glycine cleavage H-protein  37.41 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000381106 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2549  glycine cleavage system protein H, putative  35.17 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2177  glycine cleavage H-protein  35.17 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000031691 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1662  glycine cleavage system protein H  48.21 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.293907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  39.34 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  39.34 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0605  glycine cleavage system H protein  40.65 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  34.56 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  47.22 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  39.17 
 
 		 130 aa  93.6  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2078  glycine cleavage H-protein  40.17 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  44.07 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  38.94 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  39.84 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 		 131 aa  92.8  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  37.5 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  40.46 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  39.53 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  36.67 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  38.05 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  39.17 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  38.94 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  40.83 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  41.73 
 
 		 127 aa  90.5  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  38.84 
 
 		 132 aa  90.5  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  37.19 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  39.34 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  36.15 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  38.66 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  35 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  39.17 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  41.41 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  39.17 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1570  glycine cleavage H-protein  38.46 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0137365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  35.94 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  39.17 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  36.28 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  36.72 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1216  glycine cleavage system H protein  42.57 
 
 		 125 aa  87.4  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  38.28 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3845  glycine cleavage system H protein  38.68 
 
 		 128 aa  87.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  39.29 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  39.02 
 
 		 128 aa  87  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  39.02 
 
 		 128 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  39.02 
 
 		 128 aa  87  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  37.1 
 
 		 126 aa  87  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01656  glycine cleavage system protein H  38.33 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  38.94 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  38.94 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  35.71 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  36.72 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  37.4 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  38.93 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  45.26 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  36.28 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3294  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  34.38 
 
 		 128 aa  84.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  46.32 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  34.38 
 
 		 128 aa  84.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  34.38 
 
 		 128 aa  84.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  36.36 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  36.36 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  36.36 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  38.46 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  34.07 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0363  glycine cleavage system H protein  31.75 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  41.23 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  44.9 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  34.43 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  41.51 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  38.66 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  37.39 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  43.81 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  37.4 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  37.01 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  38.4 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  36.36 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  36.36 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  36.22 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  38.33 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  40 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>