More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1356 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1356  Nucleotidyl transferase  100 
 
 		 360 aa  709    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1604  nucleotidyl transferase  58.76 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0798438  normal  0.128956 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0086  sugar-phosphate nucleotidyl transferase  31.52 
 
 		 377 aa  164  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.387197  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1694  nucleotidyl transferase  32.08 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00229332  normal  0.012326 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1777  nucleotidyl transferase  29.43 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13003  normal  0.0200486 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0427  nucleotidyl transferase  31.72 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.195694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1001  nucleotidyl transferase  28.53 
 
 		 363 aa  139  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0529  hexapaptide repeat-containing transferase  28.24 
 
 		 350 aa  112  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  25.5 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.1 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.68 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  26.51 
 
 		 403 aa  106  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  27.01 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  28.1 
 
 		 385 aa  102  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  29.28 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  23.82 
 
 		 400 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  30.72 
 
 		 411 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  29.68 
 
 		 411 aa  96.3  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  25.79 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  24.35 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  30.14 
 
 		 411 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  26 
 
 		 393 aa  92.8  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  24.53 
 
 		 383 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.16 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.92 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  27.86 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  25.14 
 
 		 348 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 		 411 aa  90.9  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.81 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  24.08 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.39 
 
 		 393 aa  90.1  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  23.77 
 
 		 405 aa  89.4  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  25.94 
 
 		 393 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  25.69 
 
 		 384 aa  88.6  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  26.67 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.54 
 
 		 357 aa  87  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.08 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.6 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  27.51 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.19 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.43 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  27.84 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.54 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.24 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.99 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  24.07 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1370  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.64 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.329837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  22.78 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  22.78 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  23.86 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  22.78 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.49 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.02 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1725  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  23.39 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  24.02 
 
 		 785 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1909  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  23.39 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23479  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.91 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.97 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  26.45 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  22.86 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  22.16 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  23.92 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.41 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  25.29 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  26.42 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.06 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  26.84 
 
 		 784 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.22 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1405  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.79 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  23.5 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  26.84 
 
 		 784 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  25.66 
 
 		 784 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.66 
 
 		 784 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.12 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  25.66 
 
 		 784 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  23.92 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  25.78 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  25.66 
 
 		 784 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.46 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  23.65 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.37 
 
 		 784 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.98 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.73 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0204  nucleotidyl transferase  28.08 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  25.06 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.1 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.51 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  22.31 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  22.92 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  25.53 
 
 		 784 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  23.53 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.28 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  22.47 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  22.1 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.71 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  24.21 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  28.4 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.69 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  23.82 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  26.27 
 
 		 784 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>