64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3553 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  76.9 
 
 		 672 aa  1101    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  100 
 
 		 672 aa  1397    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  46.86 
 
 		 673 aa  670    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1042 aa  269  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1028 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  30.75 
 
 		 898 aa  246  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  29.7 
 
 		 856 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  27.67 
 
 		 840 aa  221  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  29.09 
 
 		 658 aa  211  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  25.05 
 
 		 684 aa  169  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  27.4 
 
 		 1225 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  21.64 
 
 		 704 aa  107  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  25.81 
 
 		 647 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1568  hypothetical protein  23.33 
 
 		 673 aa  97.8  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0134  hypothetical protein  22.41 
 
 		 667 aa  94.7  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0021689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  22.68 
 
 		 647 aa  92.8  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1433 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  25 
 
 		 1431 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  23.08 
 
 		 616 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1433 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  22.86 
 
 		 636 aa  85.5  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  22.86 
 
 		 636 aa  85.5  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  22.36 
 
 		 637 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  22.36 
 
 		 637 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  23.12 
 
 		 664 aa  80.5  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1338 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  24.44 
 
 		 633 aa  74.3  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  22.52 
 
 		 753 aa  69.3  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  22.62 
 
 		 638 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1096 aa  68.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  34.94 
 
 		 641 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  23.67 
 
 		 1256 aa  67.4  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  22.62 
 
 		 638 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  22.22 
 
 		 659 aa  66.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  21.74 
 
 		 633 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  28.09 
 
 		 634 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  20.8 
 
 		 634 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  21.96 
 
 		 635 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  22.14 
 
 		 633 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  42.5 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.57 
 
 		 1256 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.57 
 
 		 1256 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  18.56 
 
 		 632 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  19.87 
 
 		 1257 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  24.24 
 
 		 667 aa  60.5  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  23.21 
 
 		 647 aa  59.3  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  23.21 
 
 		 647 aa  59.3  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  26.64 
 
 		 624 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  22.63 
 
 		 636 aa  58.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  21.71 
 
 		 621 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  21.71 
 
 		 621 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  19.67 
 
 		 613 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  19.67 
 
 		 613 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1253 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  31.5 
 
 		 624 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  28.92 
 
 		 639 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  20.63 
 
 		 632 aa  54.7  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0530  tetratricopeptide TPR_4  24.17 
 
 		 1379 aa  54.3  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  24.1 
 
 		 637 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  21.13 
 
 		 621 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0428  transglutaminase domain protein  23.81 
 
 		 678 aa  51.2  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  20.92 
 
 		 665 aa  50.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  19.94 
 
 		 642 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1592  transglutaminase domain protein  25.62 
 
 		 667 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>