More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8263 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8263  homoserine/homoserine lactone efflux protein  100 
 
 		 206 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0435022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6040  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.06 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2238  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44653  normal  0.0272312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0614  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.59 
 
 		 207 aa  121  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.355661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2237  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.73 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0264903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  34.63 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  32.11 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  30.96 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  33.17 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 		 211 aa  97.8  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  31.47 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  31.25 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  31.47 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  34.47 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  29.84 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  32.11 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  32.11 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.55 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  35.27 
 
 		 211 aa  91.7  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.49 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  28.5 
 
 		 210 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  28.5 
 
 		 210 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  30.41 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  28.5 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  39.44 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  28.5 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  37.81 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  40.76 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  37.81 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  41.14 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  37.81 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  29.05 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  28.02 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  29.52 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  38.27 
 
 		 210 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  38.27 
 
 		 210 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  29.81 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  37.81 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  38.27 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  37.68 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  37.68 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  29.47 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.66 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  30.66 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29 
 
 		 234 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.88 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.72 
 
 		 218 aa  84.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  33.5 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  31.13 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  30.19 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.27 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  30.19 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  30.19 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  30.19 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  33 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.23 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  33 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  33 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  37.58 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  33.9 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  36.99 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.53 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.04 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1728  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.38 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000259292  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  30.66 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  31.47 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  39.47 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  28.65 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  32.66 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  32.66 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  28.48 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  32.66 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  32.66 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.65 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  34.97 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  35.86 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3227  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.9 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.09 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2168  lysine exporter protein LysE/YggA  34.05 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.87 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4824  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.322328  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.5 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>