More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5708 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  100 
 
 
230 aa  448  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0205731  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2054  ABC transporter related protein  56.9 
 
 
260 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00542943  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0160  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  56.03 
 
 
320 aa  238  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5354  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  52.59 
 
 
324 aa  225  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3853  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
310 aa  221  8e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00307127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  53.81 
 
 
607 aa  220  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2236  ATPase  50.21 
 
 
554 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.274783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  53.81 
 
 
603 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 
311 aa  218  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0938  ABC transporter related  41.29 
 
 
686 aa  218  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  45.56 
 
 
311 aa  218  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
311 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.16 
 
 
311 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
311 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
311 aa  217  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.16 
 
 
311 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3503  ABC transporter related  51.9 
 
 
288 aa  217  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
311 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
311 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
311 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  50.79 
 
 
541 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0145  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  47.08 
 
 
565 aa  216  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3778  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  53.33 
 
 
328 aa  215  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0965  ABC transporter related  40.82 
 
 
686 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.346759 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  51.87 
 
 
573 aa  215  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0066  ABC transporter related protein  44.94 
 
 
303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  52.61 
 
 
592 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  52.61 
 
 
592 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1040  ABC transporter related  48.37 
 
 
276 aa  214  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0900  ABC transporter-related protein  44.35 
 
 
311 aa  214  9e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0155747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3626  ABC transporter related  51.48 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1753  ATPase component ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system  48.65 
 
 
628 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1007  ABC transporter related  45.6 
 
 
313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  50.43 
 
 
573 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0845  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  44.76 
 
 
306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0435926  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0988  ABC transporter related  45.6 
 
 
313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5788  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.89 
 
 
328 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267087 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.49 
 
 
339 aa  212  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1107  ABC transporter related  47.97 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  48.52 
 
 
366 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.52 
 
 
326 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.965495  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  49.36 
 
 
561 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2722  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.94 
 
 
327 aa  211  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  51.07 
 
 
310 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  51.74 
 
 
592 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4446  ABC transporter related  43.85 
 
 
647 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  50.85 
 
 
575 aa  211  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  52.16 
 
 
584 aa  211  9e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2331  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.75 
 
 
699 aa  210  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425368  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  47.68 
 
 
370 aa  210  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  48.51 
 
 
571 aa  210  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3117  ABC type ATPase  53.25 
 
 
331 aa  210  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0682716 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0573  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  43.2 
 
 
312 aa  209  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.481261  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6444  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46 
 
 
330 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.247483 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  47.22 
 
 
562 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  49.79 
 
 
298 aa  210  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3603  ABC transporter related protein  53.07 
 
 
518 aa  209  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  48.82 
 
 
619 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  53.28 
 
 
276 aa  209  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  50 
 
 
563 aa  209  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.43 
 
 
368 aa  209  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  48.51 
 
 
572 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.73 
 
 
423 aa  209  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302511  normal  0.155474 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6267  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.4 
 
 
330 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.787873 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  51.26 
 
 
282 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  52.86 
 
 
516 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.19 
 
 
339 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633226  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  45.42 
 
 
578 aa  208  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  49.15 
 
 
643 aa  208  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5117  ABC transporter related protein  52.77 
 
 
279 aa  208  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.889797 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  47.37 
 
 
565 aa  208  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.51 
 
 
615 aa  208  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.1 
 
 
346 aa  208  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  53.07 
 
 
282 aa  207  8e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0418  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.67 
 
 
323 aa  207  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0835793 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4209  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.26 
 
 
336 aa  207  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0950  ABC transporter related  48.93 
 
 
571 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  50 
 
 
536 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  48.18 
 
 
571 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3302  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.7 
 
 
326 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26140  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.43 
 
 
665 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0117472  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0550  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 
320 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7187  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  48.37 
 
 
313 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0258  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.35 
 
 
336 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2159  oligopeptide transport ATP-binding protein  48.07 
 
 
333 aa  206  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00546678  normal  0.0666705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.39 
 
 
347 aa  206  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  48.92 
 
 
336 aa  206  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2066  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.07 
 
 
333 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.652526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2964  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.95 
 
 
364 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  50.62 
 
 
600 aa  206  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  50.65 
 
 
548 aa  206  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1956  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  48.07 
 
 
333 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.277866  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2030  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.46 
 
 
642 aa  206  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.622365 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2401  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.93 
 
 
334 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00548391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1017  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.19 
 
 
351 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0489  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.84 
 
 
674 aa  206  3e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1356  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  48.93 
 
 
334 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101924  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1395  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  48.93 
 
 
334 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0589219  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  49.14 
 
 
261 aa  206  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1733  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  48.93 
 
 
334 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.018169  normal  0.145583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>