More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2030 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2030  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
642 aa  1272    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.622365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1753  ATPase component ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system  66.03 
 
 
628 aa  768    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2331  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  56.6 
 
 
699 aa  620  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425368  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.82 
 
 
695 aa  615  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  55 
 
 
658 aa  601  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.78 
 
 
615 aa  592  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  55.13 
 
 
659 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  48.4 
 
 
603 aa  554  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  48.24 
 
 
602 aa  545  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.45 
 
 
674 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.06 
 
 
703 aa  505  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.46 
 
 
708 aa  501  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4532  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.21 
 
 
736 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.790856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  47.6 
 
 
686 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  49.42 
 
 
571 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5592  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.34 
 
 
725 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854543  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0890  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 
690 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  45.09 
 
 
712 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.9 
 
 
671 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  42.95 
 
 
620 aa  462  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.93 
 
 
711 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  49.08 
 
 
579 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 
625 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  47.06 
 
 
611 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43 
 
 
676 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4004  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.06 
 
 
611 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3945  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.06 
 
 
611 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0762521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2259  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.19 
 
 
611 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115174  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1112  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.43 
 
 
662 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663685  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 
609 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4432  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.18 
 
 
611 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.62214  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1854  ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase  45.95 
 
 
664 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11307  oligopeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter oppD  46.15 
 
 
612 aa  449  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.09 
 
 
677 aa  446  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0237  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 
673 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1361  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 
673 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0618  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.33 
 
 
725 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726649  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3806  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.76 
 
 
749 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7097  glutathione import ATP-binding protein GsiA  46.09 
 
 
718 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3727  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.14 
 
 
665 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  45.14 
 
 
619 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0974  putative dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.77 
 
 
662 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0802762  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0535  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.57 
 
 
725 aa  442  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  45.73 
 
 
613 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  44.72 
 
 
640 aa  438  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.87 
 
 
619 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.17 
 
 
626 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  43.05 
 
 
615 aa  439  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3738  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.24 
 
 
680 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.31873  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  44.07 
 
 
609 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.91 
 
 
625 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0218  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.25 
 
 
905 aa  437  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0707728  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  40.61 
 
 
578 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.54 
 
 
632 aa  435  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.28 
 
 
756 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  41.75 
 
 
601 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.14 
 
 
637 aa  432  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.21 
 
 
643 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  41.94 
 
 
629 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  41.5 
 
 
617 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.53 
 
 
631 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.77 
 
 
612 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  43.63 
 
 
623 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  38.28 
 
 
617 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  38.64 
 
 
627 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  43.77 
 
 
623 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  39.5 
 
 
564 aa  426  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.5 
 
 
634 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  43.93 
 
 
623 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  43.63 
 
 
623 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.29 
 
 
620 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  43.77 
 
 
612 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  43.63 
 
 
623 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  43.77 
 
 
623 aa  427  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  43.06 
 
 
629 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.73 
 
 
611 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  42.54 
 
 
629 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  41.83 
 
 
629 aa  423  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.7 
 
 
571 aa  425  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  41.78 
 
 
631 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  45.74 
 
 
613 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.87 
 
 
617 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  44.28 
 
 
625 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  42.05 
 
 
563 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  40.59 
 
 
566 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  43.65 
 
 
537 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.82 
 
 
623 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  41.06 
 
 
571 aa  419  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  40.51 
 
 
586 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  41.63 
 
 
640 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  41.8 
 
 
593 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.5 
 
 
643 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2459  glutathione import ATP-binding protein GsiA  42.79 
 
 
529 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.798953 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  40.56 
 
 
619 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1188  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.88 
 
 
610 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2614  ABC transporter related  42.28 
 
 
595 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3692  ABC type ATPase  44.46 
 
 
576 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.458965  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2413  glutathione import ATP-binding protein GsiA  42.79 
 
 
529 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.137702 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  40.66 
 
 
624 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2456  glutathione import ATP-binding protein GsiA  42.79 
 
 
529 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000644784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>