26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1053 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  100 
 
 		 489 aa  962    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  42.39 
 
 		 506 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  33.82 
 
 		 481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  32.47 
 
 		 525 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  31.08 
 
 		 489 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  31.57 
 
 		 563 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2911  hypothetical protein  35.71 
 
 		 494 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  0.0308568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1346  Protein of unknown function DUF2079, membrane  33.33 
 
 		 509 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  29.19 
 
 		 521 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  32.52 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  34.57 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1526  hypothetical protein  24.15 
 
 		 546 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  20.04 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  22.97 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2372  hypothetical protein  29.5 
 
 		 543 aa  55.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  27.42 
 
 		 659 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  22.04 
 
 		 463 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0320  hypothetical protein  25.48 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.935671  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  22.04 
 
 		 463 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0322  hypothetical protein  24.95 
 
 		 548 aa  50.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2371  hypothetical protein  23.66 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  20.13 
 
 		 463 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  23.32 
 
 		 498 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0720  hypothetical protein  26.88 
 
 		 562 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0371  membrane protein-like  31.98 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  27.13 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>