83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2199 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2437  hypothetical protein  94.26 
 
 		 680 aa  1334    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0176803  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2199  hypothetical protein  100 
 
 		 680 aa  1394    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.812513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1805  hypothetical protein  79.21 
 
 		 682 aa  1147    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000127719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2444  hypothetical protein  94.41 
 
 		 680 aa  1338    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0526018  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1588  hypothetical protein  79.05 
 
 		 691 aa  1129    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000609017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1781  hypothetical protein  90 
 
 		 680 aa  1288    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000258085  normal  0.0160925 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2225  hypothetical protein  78.83 
 
 		 682 aa  1131    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218446  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1751  hypothetical protein  90.15 
 
 		 680 aa  1290    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00124169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1676  hypothetical protein  90 
 
 		 680 aa  1288    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00163825  normal  0.33231 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1998  hypothetical protein  52.31 
 
 		 688 aa  691    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000875403  n/a   
 
 
 
NC_007954  Sden_1725  hypothetical protein  71.78 
 
 		 682 aa  1053    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000149613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2480  hypothetical protein  77 
 
 		 686 aa  1113    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0308258  normal  0.0283529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1938  hypothetical protein  77.6 
 
 		 682 aa  1117    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00596375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2557  hypothetical protein  94.41 
 
 		 680 aa  1338    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0938481  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1907  protein of unknown function DUF1302  94.41 
 
 		 680 aa  1337    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00456554  normal  0.102822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2136  hypothetical protein  77.01 
 
 		 682 aa  1115    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2806  hypothetical protein  53.08 
 
 		 696 aa  719    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2597  hypothetical protein  90.74 
 
 		 680 aa  1291    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02007  hypothetical protein  46.12 
 
 		 455 aa  393  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000421467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4424  hypothetical protein  34.78 
 
 		 639 aa  340  7e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13130  hypothetical protein  34.67 
 
 		 641 aa  339  8e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0792  hypothetical protein  33.66 
 
 		 628 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178452  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0806  hypothetical protein  33.66 
 
 		 628 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1184  hypothetical protein  34.19 
 
 		 641 aa  334  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3167  hypothetical protein  34.56 
 
 		 661 aa  333  6e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.719833  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0765  hypothetical protein  33.52 
 
 		 628 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3432  hypothetical protein  34.96 
 
 		 620 aa  327  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19810  hypothetical protein  35.85 
 
 		 585 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.177739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4708  hypothetical protein  34.7 
 
 		 629 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0952361  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1704  putative lipoprotein  35.55 
 
 		 585 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0991  hypothetical protein  33.38 
 
 		 645 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.868412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1149  hypothetical protein  32.95 
 
 		 645 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0905  hypothetical protein  33.43 
 
 		 597 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2695  hypothetical protein  32.61 
 
 		 615 aa  306  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000566517  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1134  hypothetical protein  33.28 
 
 		 597 aa  306  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0224  hypothetical protein  33.04 
 
 		 603 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2320  hypothetical protein  30 
 
 		 606 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1720  hypothetical protein  30.7 
 
 		 593 aa  281  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  0.287373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2042  hypothetical protein  30.67 
 
 		 618 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3700  hypothetical protein  30.81 
 
 		 617 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0576544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2938  hypothetical protein  29.08 
 
 		 665 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140535  normal  0.820157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3145  hypothetical protein  32.09 
 
 		 617 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3660  hypothetical protein  31.49 
 
 		 659 aa  256  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24290  glycine betaine transmethylase  31.71 
 
 		 654 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000902449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2057  hypothetical protein  31.54 
 
 		 654 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2628  glycine betaine transmethylase  30.42 
 
 		 649 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41220  hypothetical protein  29.9 
 
 		 608 aa  236  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0390938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1361  hypothetical protein  27.72 
 
 		 665 aa  229  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0467  hypothetical protein  29.32 
 
 		 617 aa  216  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1023  hypothetical protein  28.47 
 
 		 608 aa  213  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.318112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0466  hypothetical protein  27.86 
 
 		 609 aa  212  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0087  hypothetical protein  29.1 
 
 		 665 aa  202  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0162  hypothetical protein  26.93 
 
 		 586 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2972  protein of unknown function DUF1302  26.72 
 
 		 575 aa  158  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.715393  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2811  hypothetical protein  25.5 
 
 		 548 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1511  hypothetical protein  24.6 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4864  hypothetical protein  24.8 
 
 		 609 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156964  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4347  hypothetical protein  25.51 
 
 		 609 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5819  hypothetical protein  25.26 
 
 		 614 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5041  hypothetical protein  25.26 
 
 		 614 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.351751  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4360  hypothetical protein  25.22 
 
 		 614 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6839  hypothetical protein  24.71 
 
 		 613 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0699678  normal  0.0739476 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2582  hypothetical protein  23.13 
 
 		 612 aa  111  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6389  hypothetical protein  25.17 
 
 		 610 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707198  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2750  hypothetical protein  28.72 
 
 		 548 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3200  hypothetical protein  25.07 
 
 		 570 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.51508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6782  hypothetical protein  31.68 
 
 		 568 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4434  protein of unknown function DUF1302  24.63 
 
 		 611 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0662376  normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4324  protein of unknown function DUF1302  24.63 
 
 		 611 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.406766  normal  0.0355116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0964  hypothetical protein  23.84 
 
 		 569 aa  94.4  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00077396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3147  hypothetical protein  21.95 
 
 		 536 aa  92  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1461  hypothetical protein  21.68 
 
 		 521 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.890943  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2166  hypothetical protein  25.6 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0130  hypothetical protein  24.74 
 
 		 557 aa  82.8  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6864  hypothetical protein  22.43 
 
 		 565 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000183389  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2669  hypothetical protein  24.2 
 
 		 651 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.575021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2162  hypothetical protein  22.59 
 
 		 567 aa  68.2  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0648  hypothetical protein  24.85 
 
 		 568 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466396  normal  0.419357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2812  hypothetical protein  23.69 
 
 		 651 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2248  hypothetical protein  33.94 
 
 		 544 aa  61.2  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000000224157  decreased coverage  4.957600000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3919  hypothetical protein  25.07 
 
 		 594 aa  60.8  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4026  hypothetical protein  27.64 
 
 		 602 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4059  protein of unknown function DUF1302  27.42 
 
 		 594 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>