101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0689 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0689  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 121 aa  248  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0534025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0688  thioredoxin domain-containing protein  84.07 
 
 		 115 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0658  thioredoxin domain-containing protein  80.53 
 
 		 115 aa  191  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0678  thioredoxin domain-containing protein  80.91 
 
 		 119 aa  191  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3375  thioredoxin domain-containing protein  68.18 
 
 		 120 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0578  thioredoxin domain-containing protein  69.09 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3546  hypothetical protein  66.67 
 
 		 117 aa  153  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0503  thioredoxin domain-containing protein  52.88 
 
 		 113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0732  hypothetical protein  65 
 
 		 80 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3583  thioredoxin domain-containing protein  46.15 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0886  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  36.45 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1211  hypothetical protein  36.54 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  35.51 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  30.77 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  30.48 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2062  thioredoxin domain-containing protein  26.36 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228901  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  30.48 
 
 		 281 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  30.48 
 
 		 281 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  36.26 
 
 		 289 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  30.93 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  29 
 
 		 297 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  28.57 
 
 		 310 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  27.62 
 
 		 280 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  31.37 
 
 		 272 aa  47.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  31.17 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  28.26 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  26.14 
 
 		 280 aa  47  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  26.88 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  28.89 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  26.88 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  24.73 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  29.17 
 
 		 269 aa  45.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  25.81 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  25.84 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0889  glutaredoxin 2  29.21 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.816837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0471  Thioredoxin domain  28.75 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  32.93 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  24.3 
 
 		 303 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  29.36 
 
 		 268 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  27.71 
 
 		 287 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  25 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  30.21 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  28.4 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0788  thioredoxin  24.72 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  30.59 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  28.42 
 
 		 285 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  22.68 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  37.1 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  27.03 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  21.57 
 
 		 304 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  28.42 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  27.06 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  31.08 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  21.57 
 
 		 304 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  21.78 
 
 		 304 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  28.24 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  27.06 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  30.77 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  25.26 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  30.77 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  32.53 
 
 		 272 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  32.39 
 
 		 277 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  26.97 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  28.26 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  31.75 
 
 		 547 aa  41.2  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  27.72 
 
 		 331 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  26.09 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  23.38 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  23.38 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  23.38 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  23.38 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  23.38 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  24.55 
 
 		 329 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  30.34 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0272  thioredoxin domain-containing protein  27 
 
 		 281 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0149418  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  30.34 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  30.34 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  26.19 
 
 		 289 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  26.19 
 
 		 289 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  26.03 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  23.48 
 
 		 293 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2478  thioredoxin domain-containing protein  29.27 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  28.42 
 
 		 285 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  28.09 
 
 		 282 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  30 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  27.71 
 
 		 286 aa  40.4  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 460 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  30.23 
 
 		 282 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  30.23 
 
 		 282 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  26.51 
 
 		 282 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  27.17 
 
 		 146 aa  40  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  26.51 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  26.51 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  29.11 
 
 		 555 aa  40.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2559  hypothetical protein  21.36 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2612  hypothetical protein  21.36 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  32.91 
 
 		 287 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  26.74 
 
 		 282 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  30.23 
 
 		 301 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  26.74 
 
 		 282 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>