270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4723 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02262  predicted outer membrane export usher protein  55.09 
 
 		 881 aa  966    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0215  fimbrial usher protein  52.21 
 
 		 885 aa  937    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00519356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.96 
 
 		 832 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3270  fimbrial usher protein  54.87 
 
 		 881 aa  913    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142463  normal  0.0139544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4146  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  67.46 
 
 		 846 aa  1189    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3480  fimbrial usher protein  55.76 
 
 		 860 aa  945    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0233  fimbrial usher protein  52.44 
 
 		 885 aa  939    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.516859  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0252  fimbrial usher protein  47.3 
 
 		 826 aa  816    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00772695  hitchhiker  0.00000864074 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0232  fimbrial usher protein  52.21 
 
 		 885 aa  938    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02223  hypothetical protein  53.2 
 
 		 579 aa  649    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2717  fimbrial usher family protein  55.03 
 
 		 880 aa  969    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.405081  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0217  fimbrial usher protein  52.21 
 
 		 885 aa  936    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.609825 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1315  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  55.32 
 
 		 881 aa  970    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4723  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 844 aa  1737    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4673  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  48.05 
 
 		 828 aa  830    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2632  fimbrial usher family protein  55.08 
 
 		 881 aa  969    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0695  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  47.18 
 
 		 826 aa  814    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0825  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.53 
 
 		 845 aa  707    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0403  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  59.25 
 
 		 835 aa  1018    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2489  fimbrial usher family protein  55.15 
 
 		 880 aa  970    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0614  fimbrial usher protein  47.42 
 
 		 826 aa  824    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3172  fimbrial usher protein  54.99 
 
 		 881 aa  914    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.287175  normal  0.39987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3153  fimbrial usher protein  54.99 
 
 		 881 aa  915    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.112503 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2496  fimbrial usher protein  55.21 
 
 		 882 aa  959    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4106  fimbrial usher protein  42.01 
 
 		 830 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3089  fimbrial usher protein  54.87 
 
 		 881 aa  912    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3363  fimbrial usher protein  40.57 
 
 		 829 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0678454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3261  fimbrial usher protein  40.57 
 
 		 829 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.313341 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3247  fimbrial usher protein  40.5 
 
 		 829 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239063  normal  0.0404863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3184  fimbrial usher protein  40.38 
 
 		 829 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3198  fimbrial usher protein  40.45 
 
 		 829 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3222  fimbrial usher protein  39.61 
 
 		 833 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000448746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0653  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.85 
 
 		 832 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02916  predicted outer membrane usher protein  39.31 
 
 		 822 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.31 
 
 		 821 aa  569  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3509  fimbrial usher protein  39.73 
 
 		 834 aa  571  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00630946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02866  hypothetical protein  39.31 
 
 		 812 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419634  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0808  fimbrial usher protein  39.02 
 
 		 816 aa  561  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.404851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.71 
 
 		 828 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4772  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.98 
 
 		 828 aa  548  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0635  fimbrial usher family protein  39.02 
 
 		 833 aa  548  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2937  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.78 
 
 		 819 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0744  fimbrial usher family protein  38.78 
 
 		 833 aa  544  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1147  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.71 
 
 		 828 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1627  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.71 
 
 		 828 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0766  fimbrial usher family protein  38.78 
 
 		 833 aa  545  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00678  predicted outer membrane protein  38.44 
 
 		 816 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2918  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.9 
 
 		 818 aa  534  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.528881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1611  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.45 
 
 		 829 aa  535  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0173282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1547  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.61 
 
 		 817 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160729  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1524  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.87 
 
 		 828 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00667  hypothetical protein  38.61 
 
 		 792 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2061  MrfC  36.09 
 
 		 813 aa  502  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.09 
 
 		 813 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1910  fimbrial usher protein  36.16 
 
 		 813 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1897  fimbrial usher protein  36.16 
 
 		 813 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377011  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04794  porin PapC  32.31 
 
 		 820 aa  355  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  30.66 
 
 		 863 aa  340  8e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  30.43 
 
 		 878 aa  337  7e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  30.43 
 
 		 878 aa  337  7e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  30.48 
 
 		 856 aa  335  3e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.32 
 
 		 878 aa  333  6e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  30.21 
 
 		 878 aa  332  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  30.35 
 
 		 839 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  30.23 
 
 		 840 aa  326  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.01 
 
 		 877 aa  322  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  30.91 
 
 		 809 aa  314  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  30.8 
 
 		 809 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02222  hypothetical protein  59.39 
 
 		 298 aa  313  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  30.79 
 
 		 809 aa  313  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  30.79 
 
 		 809 aa  313  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  30.55 
 
 		 809 aa  310  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.74 
 
 		 840 aa  308  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.57 
 
 		 838 aa  299  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  29.94 
 
 		 863 aa  298  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.63 
 
 		 876 aa  298  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.45 
 
 		 838 aa  297  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  29.45 
 
 		 838 aa  297  6e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  29.45 
 
 		 838 aa  297  6e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  29.45 
 
 		 838 aa  296  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  29.34 
 
 		 838 aa  295  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30 
 
 		 851 aa  295  3e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  29.29 
 
 		 866 aa  294  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.93 
 
 		 837 aa  293  9e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  29.69 
 
 		 866 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.92 
 
 		 865 aa  293  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  29.85 
 
 		 839 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  28.47 
 
 		 871 aa  293  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  31.13 
 
 		 850 aa  292  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  30.15 
 
 		 861 aa  292  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.97 
 
 		 886 aa  292  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.36 
 
 		 866 aa  291  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  28.95 
 
 		 866 aa  291  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  28.95 
 
 		 866 aa  290  9e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  29.25 
 
 		 866 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  29.25 
 
 		 866 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0148  putative outer membrane usher protein  29.43 
 
 		 866 aa  289  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.234756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.17 
 
 		 832 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  30.88 
 
 		 833 aa  289  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  30.49 
 
 		 833 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>