288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3766 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3766  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 482 aa  957    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000840749  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2823  inner membrane transporter YbgH  66.25 
 
 		 486 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2719  inner membrane transporter YbgH  66.25 
 
 		 486 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.945342  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2761  inner membrane transporter YbgH  66.25 
 
 		 486 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2802  inner membrane transporter YbgH  66.25 
 
 		 486 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.883594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2936  inner membrane transporter YbgH  66.25 
 
 		 486 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04001  predicted transporter  66.38 
 
 		 485 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3861  amino acid/peptide transporter  66.38 
 
 		 485 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4371  amino acid/peptide transporter  66.38 
 
 		 485 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113976  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3897  amino acid/peptide transporter  66.38 
 
 		 485 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4685  amino acid/peptide transporter  66.38 
 
 		 485 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5646  amino acid/peptide transporter  66.17 
 
 		 485 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03963  hypothetical protein  66.38 
 
 		 485 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4599  amino acid/peptide transporter  66.17 
 
 		 485 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0867  inner membrane transporter YbgH  62.03 
 
 		 493 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0818  inner membrane transporter YbgH  62.45 
 
 		 493 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  62.45 
 
 		 493 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  62.45 
 
 		 493 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  62.24 
 
 		 493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00669  predicted transporter  59.34 
 
 		 493 aa  559  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2946  amino acid/peptide transporter  59.34 
 
 		 493 aa  558  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0724  amino acid/peptide transporter  59.55 
 
 		 493 aa  560  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470702  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0799  amino acid/peptide transporter  59.34 
 
 		 493 aa  559  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.256216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00658  hypothetical protein  59.34 
 
 		 493 aa  559  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0626  amino acid/peptide transporter  58.93 
 
 		 493 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2927  amino acid/peptide transporter  59.14 
 
 		 493 aa  557  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0734  amino acid/peptide transporter  58.93 
 
 		 493 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0757  amino acid/peptide transporter  59.14 
 
 		 493 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  35.06 
 
 		 516 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  33.74 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  33.61 
 
 		 527 aa  229  7e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  31.3 
 
 		 534 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  32.34 
 
 		 507 aa  206  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  30.91 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  31.33 
 
 		 461 aa  203  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  31.59 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  34.7 
 
 		 432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  27.65 
 
 		 507 aa  199  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1177  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  30.22 
 
 		 506 aa  200  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.980946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  30.49 
 
 		 539 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  29.88 
 
 		 539 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  29.88 
 
 		 539 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  29.88 
 
 		 539 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  32.02 
 
 		 463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  30.67 
 
 		 462 aa  196  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  32.74 
 
 		 496 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  32.03 
 
 		 490 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  32.51 
 
 		 491 aa  193  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  31.4 
 
 		 490 aa  192  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3183  amino acid/peptide transporter  29.2 
 
 		 517 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0376329 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  33.88 
 
 		 483 aa  192  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1117  amino acid/peptide transporter  29.2 
 
 		 523 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  31.2 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  31.2 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  31.2 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  31.2 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1174  amino acid/peptide transporter  29.25 
 
 		 521 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211879  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  30.96 
 
 		 492 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  31.2 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  31.2 
 
 		 461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  30.96 
 
 		 492 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1207  amino acid/peptide transporter  29.2 
 
 		 517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0390922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  31 
 
 		 461 aa  191  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1102  amino acid/peptide transporter  28.8 
 
 		 546 aa  190  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  31.77 
 
 		 489 aa  190  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  32.18 
 
 		 489 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  32.18 
 
 		 489 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  31.2 
 
 		 461 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  31.01 
 
 		 462 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2910  amino acid/peptide transporter  29.08 
 
 		 516 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.380758  normal  0.476442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3089  amino acid/peptide transporter  28.8 
 
 		 516 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000368989  normal  0.0911268 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  31 
 
 		 461 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2992  amino acid/peptide transporter  29.08 
 
 		 516 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0360187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  31.72 
 
 		 500 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  29.64 
 
 		 497 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  32.14 
 
 		 489 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  31.75 
 
 		 489 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1277  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  29 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  29.46 
 
 		 524 aa  188  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  30.86 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4728  amino acid/peptide transporter  30.17 
 
 		 506 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  29.37 
 
 		 479 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  30.89 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0113  amino acid/peptide transporter  29.83 
 
 		 506 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  30.89 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  30.8 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  30.5 
 
 		 446 aa  187  4e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  28.69 
 
 		 506 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0234728 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  30.5 
 
 		 446 aa  187  4e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2221  amino acid/peptide transporter  29.07 
 
 		 551 aa  187  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  29.98 
 
 		 544 aa  186  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  30.6 
 
 		 451 aa  186  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  29.37 
 
 		 497 aa  186  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5415  amino acid/peptide transporter  29.79 
 
 		 506 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4868  amino acid/peptide transporter  29.79 
 
 		 507 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1255  amino acid/peptide transporter  29.92 
 
 		 551 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  31.38 
 
 		 477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2907  amino acid/peptide transporter  29.92 
 
 		 500 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  28.06 
 
 		 495 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3023  amino acid/peptide transporter  29.92 
 
 		 500 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>