More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5946 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 322 aa  645    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  56.25 
 
 		 331 aa  352  4e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  59.51 
 
 		 344 aa  349  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  60.46 
 
 		 352 aa  344  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  57.59 
 
 		 356 aa  341  8e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  54.97 
 
 		 331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  55.86 
 
 		 349 aa  331  9e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  52.47 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  54.69 
 
 		 331 aa  315  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  53.09 
 
 		 338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  52.62 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  51.39 
 
 		 351 aa  308  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  52.66 
 
 		 334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  51.71 
 
 		 334 aa  306  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  51.7 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  51.06 
 
 		 338 aa  299  5e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  51.69 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0988  Polyprenyl synthetase  52.01 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  50 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  49.69 
 
 		 335 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  49.69 
 
 		 342 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  45.57 
 
 		 335 aa  272  6e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  49.69 
 
 		 329 aa  272  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  47.12 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  45.59 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  48.15 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  45.4 
 
 		 337 aa  266  5e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  47.38 
 
 		 335 aa  265  5.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  45.9 
 
 		 343 aa  263  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  43.96 
 
 		 366 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  47.94 
 
 		 344 aa  255  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  45.99 
 
 		 354 aa  253  5.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  45.2 
 
 		 367 aa  251  8.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10572  polyprenyl-diphosphate synthase grcC1  46.89 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.441257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  48.11 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  51.68 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11007  polyprenyl-diphosphate synthase grcC2  38.68 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000025551  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.57 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  35.71 
 
 		 318 aa  190  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.58 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.92 
 
 		 320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  33.88 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  33.97 
 
 		 333 aa  179  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  30.99 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.01 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  32.61 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.22 
 
 		 323 aa  175  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.22 
 
 		 323 aa  175  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.22 
 
 		 320 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.22 
 
 		 320 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.22 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.9 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.58 
 
 		 320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.58 
 
 		 320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.57 
 
 		 320 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.26 
 
 		 320 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  34.28 
 
 		 336 aa  172  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  33.01 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  32.58 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  32.8 
 
 		 323 aa  169  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.9 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  34.19 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  34.98 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  31.09 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  31.68 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  30.1 
 
 		 323 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  32.38 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  32.81 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  35.14 
 
 		 335 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  34.93 
 
 		 344 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  31.86 
 
 		 322 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  35.05 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.54 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  31.49 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  35.05 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  29.41 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  34.08 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  31.95 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  33.54 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  32.56 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  31.29 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  30.91 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  30.42 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  30.42 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  30.42 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  31.91 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  30.42 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  33.12 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  32.14 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  30.63 
 
 		 324 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  33.77 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  32.01 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  32.01 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  32.01 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  32.01 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  32.01 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  30.41 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  35.15 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  32.01 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  32.01 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>