58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5585 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5585  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 258 aa  518  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2675  pentapeptide repeat-containing protein  62.45 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3680  pentapeptide repeat protein  58.56 
 
 		 266 aa  292  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0611357  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3823  pentapeptide repeat protein  44.31 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.199719  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1041  pentapeptide repeat-containing protein  42.8 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3732  pentapeptide repeat-containing protein  41.08 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.612833  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2076  pentapeptide repeat-containing protein  39.85 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0171382  normal  0.301394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0945  pentapeptide repeat protein  41.34 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4160  pentapeptide repeat-containing protein  38.21 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3749  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.44 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6057  pentapeptide repeat protein  40.74 
 
 		 126 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  32.18 
 
 		 168 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  34.45 
 
 		 600 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  31.43 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  37.37 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  32.79 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  31.43 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  40.86 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  29.91 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.94 
 
 		 14916 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  27.88 
 
 		 447 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  34.09 
 
 		 493 aa  46.6  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  36.67 
 
 		 973 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2777  pentapeptide repeat-containing protein  31.08 
 
 		 124 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.13799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  33.11 
 
 		 412 aa  46.2  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  29.13 
 
 		 489 aa  45.4  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  36.56 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  44.23 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  31.52 
 
 		 145 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  32.35 
 
 		 576 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  26.36 
 
 		 607 aa  44.7  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  34.88 
 
 		 420 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  36.96 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  40.3 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  31.52 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 		 332 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  26.61 
 
 		 635 aa  43.9  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  32.82 
 
 		 1033 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  34.38 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28820  uncharacterized low-complexity protein  45.9 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  28.81 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  31.39 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3874  pentapeptide repeat protein  44.23 
 
 		 152 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  29.76 
 
 		 386 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  40.3 
 
 		 184 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  37.8 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3923  pentapeptide repeat protein  44.23 
 
 		 167 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0131528  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  28.41 
 
 		 517 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3027  Ion transport 2 domain protein  34.29 
 
 		 346 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  32.93 
 
 		 601 aa  43.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 452 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  23.88 
 
 		 218 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2510  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 		 308 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115896  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  27.84 
 
 		 408 aa  43.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2180  acetyltransferase  28.99 
 
 		 308 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000230557  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  37.89 
 
 		 389 aa  42.4  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  30.34 
 
 		 681 aa  42  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1115  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 		 168 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>