97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1262 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 		 83 aa  163  6.9999999999999995e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  56.96 
 
 		 82 aa  99.8  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  43.21 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  47.22 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  46.75 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.25 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  44.3 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.38 
 
 		 81 aa  70.1  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  48.61 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  48.61 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  48.61 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  48.61 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  48.61 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  48.61 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  48.61 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  48.61 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  48.61 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  43.21 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  46.05 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  48.61 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.61 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  42.17 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  46.34 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  43.04 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.21 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  45.71 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  46.05 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  42.11 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  46.67 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  44.74 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  45.9 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.87 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  48.21 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  40.51 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  42.31 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  38.96 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.51 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  41.77 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.48 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.48 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  40.51 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  40.62 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.82 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  40.62 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  41.67 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  39.06 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  41.03 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  41.03 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.9 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  39.74 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  41.67 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  38.27 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0701  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.18 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584893  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0725  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.18 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  37.5 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1152  RNA-binding S4  32.93 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  36.36 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1589  RNA-binding S4  34.38 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292038  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0783  RNA-binding S4 domain protein  34.85 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.85 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1408  RNA-binding S4 domain protein  38.1 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3816  RNA-binding S4 domain protein  41.27 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1265  RNA-binding S4  46.94 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_004310  BR1769  S4 domain-containing protein  45.16 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00186229  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1704  S4 domain-containing protein  45.16 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000120647  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3766  RNA-binding S4 domain protein  31.75 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3977  RNA-binding S4  39.68 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  47.92 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  34.92 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.87 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.82 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  36.51 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.68 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4145  RNA-binding S4 domain protein  36.07 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00358157  normal  0.0781043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4432  RNA-binding S4 domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1642  RNA-binding S4  34.92 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.605711  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1132  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.94 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0247911  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  38.1 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.68 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  36.67 
 
 		 131 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_002950  PG0165  heat shock protein 15  34.92 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  33.85 
 
 		 131 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3582  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.75 
 
 		 127 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3749  RNA-binding S4 domain protein  30.65 
 
 		 127 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0879  RNA-binding S4 domain protein  33.33 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3883  RNA-binding S4 domain protein  36.07 
 
 		 293 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  38.1 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26490  heat shock protein Hsp15  33.87 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468539  normal  0.352785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  40.82 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2642  putative heat shock protein 15  33.33 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12510  heat shock protein Hsp15  31.75 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0051  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.38 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0122  RNA-binding S4  35.38 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  32.79 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1162  RNA-binding S4 domain protein  31.75 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1720  RNA-binding S4 domain protein  38.1 
 
 		 93 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>