82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1152 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1152  RNA-binding S4  100 
 
 		 82 aa  161  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  60.49 
 
 		 81 aa  107  6e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  58.97 
 
 		 81 aa  103  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  57.69 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  57.69 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  56.79 
 
 		 81 aa  99  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  55.56 
 
 		 82 aa  93.6  9e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1026  RNA-binding S4 domain protein  56.25 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.319411  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  50.62 
 
 		 81 aa  87.8  5e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  50.62 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  40.98 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  31.65 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  32.93 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.8 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  32.93 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  31.71 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  41.27 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.39 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  31.51 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  31.51 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  41.27 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.18 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  38.33 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  36.25 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0103  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.18 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  38.1 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  39.68 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  31.82 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  39.68 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.98 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  42 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  37.25 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0095  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.51 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  35.21 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  35.21 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  35.21 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  35.21 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  35.21 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  35.21 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  35.21 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  35.21 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  35.21 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.16 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.38 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  30.38 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  38 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.3 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0019  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.86 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.329407  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03954  heat shock protein 15  32.79 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  33.33 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.8 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0119  RNA-binding S4  38.78 
 
 		 132 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0359647  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.18 
 
 		 79 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  30.99 
 
 		 122 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0167  heat shock protein 15  38.78 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0728996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4208  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.78 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0164  heat shock protein 15  31.65 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0150  RNA-binding S4 domain protein  38.78 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  31.25 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.82 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0151  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.78 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.245693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0147  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.78 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834314  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.82 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  40.82 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  37.25 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0154  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.49 
 
 		 132 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.21 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3569  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.78 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0348447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.78 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2209  heat shock protein 15  29.11 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3325  heat shock protein 15  29.11 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3314  heat shock protein 15  29.11 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3281  heat shock protein 15  29.11 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1102  heat shock protein 15  29.11 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346027  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0497  heat shock protein 15  29.11 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.673566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2329  heat shock protein 15  29.11 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  31.37 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  33.33 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.78 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.78 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0188  RNA-binding S4 domain protein  29.63 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327144  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  32 
 
 		 139 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>