91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0628 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0628  sporulation integral membrane protein YtvI  100 
 
 
367 aa  706    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0189  sporulation integral membrane protein YtvI  29.1 
 
 
383 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1013  hypothetical protein  29.03 
 
 
360 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395023  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0024  hypothetical protein  29.18 
 
 
355 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  28.7 
 
 
353 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1040  hypothetical protein  30.21 
 
 
366 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00428171  unclonable  0.0000000129007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3205  sporulation integral membrane protein YtvI  28.25 
 
 
362 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000954806  hitchhiker  0.000000642415 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  26.89 
 
 
372 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  26.89 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  26.89 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  26.63 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  26.89 
 
 
372 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  27.08 
 
 
365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  26.89 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  26.63 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  27.87 
 
 
358 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  27.13 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2429  hypothetical protein  27.76 
 
 
356 aa  119  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4426  sporulation integral membrane protein YtvI  27.42 
 
 
372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  25.34 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2924  sporulation integral membrane protein YtvI  27.12 
 
 
354 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2683  sporulation integral membrane protein YtvI  23.26 
 
 
372 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0571053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07720  Sporulation integral membrane protein YtvI  27.02 
 
 
355 aa  102  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0985  sporulation integral membrane protein YtvI  27.48 
 
 
341 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3703  sporulation integral membrane protein YtvI  27.61 
 
 
365 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000243637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2662  sporulation integral membrane protein YtvI  27.51 
 
 
354 aa  99.4  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  28.72 
 
 
370 aa  99.4  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1971  hypothetical protein  26.89 
 
 
362 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0779  sporulation integral membrane protein YtvI  24.02 
 
 
372 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0429  sporulation integral membrane protein YtvI  28.51 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0585  sporulation integral membrane protein YtvI  26.56 
 
 
351 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3488  sporulation integral membrane protein YtvI  26.39 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000381599  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3838  sporulation integral membrane protein YtvI  26.6 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0427  sporulation integral membrane protein YtvI  27.8 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2466  sporulation integral membrane protein YtvI  24.27 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.180742  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2984  sporulation integral membrane protein YtvI  27.81 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1173  protein of unknown function UPF0118  24.19 
 
 
386 aa  63.9  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  26.8 
 
 
393 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  29.84 
 
 
360 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  28.09 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  25.97 
 
 
321 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  25.87 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  27.73 
 
 
423 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.73 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  21.11 
 
 
349 aa  53.5  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  23.73 
 
 
351 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  25.36 
 
 
336 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2217  hypothetical protein  25.74 
 
 
351 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253249  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  26.4 
 
 
334 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0115  sporulation integral membrane protein YtvI  30.21 
 
 
356 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00027098  hitchhiker  0.00391046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  24.28 
 
 
542 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  24.43 
 
 
358 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  30.63 
 
 
365 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  30.17 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  24.62 
 
 
345 aa  47.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  28.83 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  24.35 
 
 
345 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  27.91 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  24.09 
 
 
363 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  24 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  27.91 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  21.35 
 
 
393 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  30.39 
 
 
361 aa  47  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5612  protein of unknown function UPF0118  26.79 
 
 
383 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  31.65 
 
 
345 aa  47  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4237  protein of unknown function UPF0118  25.77 
 
 
350 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  29.45 
 
 
334 aa  47  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  30.36 
 
 
347 aa  46.6  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  23.5 
 
 
336 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  27.88 
 
 
354 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  28 
 
 
344 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  26.45 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0566  hypothetical protein  25.33 
 
 
394 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.0679598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  28.89 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  29.91 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  22.55 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  28.97 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  28.83 
 
 
371 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  32.35 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  24.54 
 
 
415 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  35.29 
 
 
352 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  21.36 
 
 
366 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  26.96 
 
 
355 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  27.78 
 
 
368 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  35.71 
 
 
352 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  32.04 
 
 
354 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  21.32 
 
 
366 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  26.37 
 
 
379 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  30.69 
 
 
353 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0372  hypothetical protein  21.04 
 
 
339 aa  43.1  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  25.51 
 
 
363 aa  42.7  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>