56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2242 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  58.88 
 
 		 205 aa  235  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  59.9 
 
 		 205 aa  234  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  42.86 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  35.57 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  34.55 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  34.03 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  35.24 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  33.01 
 
 		 589 aa  62.4  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  48.94 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  39.76 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  29.36 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  32.22 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  35.16 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  35.44 
 
 		 287 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  38.55 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4035  hypothetical protein  43.75 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  31.19 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0733  hypothetical protein  44.83 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  43.48 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1695  hypothetical protein  40.22 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.782082  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  31.82 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  35.71 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  40.54 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  40.58 
 
 		 104 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  38.16 
 
 		 95 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  31.13 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0328  SH3 type 3 domain-containing protein  38.04 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.213392  normal  0.64697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  40.91 
 
 		 129 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1254  hypothetical protein  53.33 
 
 		 105 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0464649  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4458  SH3 type 3 domain-containing protein  32.65 
 
 		 281 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4026  SH3 type 3 domain-containing protein  30.48 
 
 		 289 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239277 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  35.53 
 
 		 167 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  41.89 
 
 		 132 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3677  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566857  hitchhiker  0.00495452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3545  SH3 type 3 domain-containing protein  31.58 
 
 		 283 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  28.21 
 
 		 184 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4134  SH3 type 3 domain-containing protein  30.48 
 
 		 312 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4232  SH3, type 3  30.48 
 
 		 312 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3385  SH3 type 3 domain-containing protein  30.48 
 
 		 301 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  47.06 
 
 		 131 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  48.78 
 
 		 129 aa  45.1  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  39.13 
 
 		 139 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  37.84 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1900  SH3 domain-containing protein  29.47 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00351157  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  45.59 
 
 		 131 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6932  protein of unknown function DUF1236  44.29 
 
 		 131 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4403  SH3 type 3 domain-containing protein  32.35 
 
 		 353 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  37.84 
 
 		 137 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0168  SH3 type 3 domain protein  35.23 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1396  protein of unknown function DUF1236  43.24 
 
 		 132 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.955591 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  35.8 
 
 		 137 aa  41.6  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  35.37 
 
 		 137 aa  41.6  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  35.8 
 
 		 137 aa  41.6  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  35.8 
 
 		 139 aa  41.6  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>