More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2236 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 396 aa  799    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  64.53 
 
 		 379 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  61.73 
 
 		 380 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  48.6 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  47.11 
 
 		 388 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  47.07 
 
 		 383 aa  324  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  50.86 
 
 		 382 aa  324  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  45.04 
 
 		 387 aa  322  8e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  52.33 
 
 		 399 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  45.53 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  45.55 
 
 		 382 aa  317  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  48.62 
 
 		 405 aa  316  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  44.85 
 
 		 387 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  45.28 
 
 		 375 aa  309  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  42.6 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  45.74 
 
 		 376 aa  305  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  49.12 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  42.41 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  44.15 
 
 		 368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  48.98 
 
 		 360 aa  302  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  45.17 
 
 		 406 aa  301  9e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  46.32 
 
 		 376 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  42.82 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  44.6 
 
 		 397 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  47.7 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  46.56 
 
 		 396 aa  298  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  44.85 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  47.56 
 
 		 392 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  43.7 
 
 		 412 aa  296  5e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  47.49 
 
 		 384 aa  295  7e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  43.97 
 
 		 403 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  45.76 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  41.07 
 
 		 389 aa  292  9e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  46.35 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  43.08 
 
 		 366 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  44.06 
 
 		 381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  42.79 
 
 		 391 aa  289  8e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  43.34 
 
 		 392 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  43.08 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  45.26 
 
 		 378 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  44.8 
 
 		 430 aa  286  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  40.5 
 
 		 418 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  44.44 
 
 		 381 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  44.09 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  44.39 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1523  soluble aldose sugar dehydrogenase  45.35 
 
 		 369 aa  282  7.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  42.5 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  46.86 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  42.74 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  44.66 
 
 		 381 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  43.94 
 
 		 386 aa  279  8e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  43.59 
 
 		 377 aa  277  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  43.09 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  43.15 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  42.64 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  43.34 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  41.6 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  44.16 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  40.86 
 
 		 386 aa  269  5e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2109  glucose sorbosone dehydrogenase  44.95 
 
 		 378 aa  269  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  41.64 
 
 		 392 aa  268  8e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  41.33 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  44.63 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  44.85 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  41.91 
 
 		 375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  43.89 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  41.29 
 
 		 373 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  41.52 
 
 		 388 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  40.49 
 
 		 465 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  39.64 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  40.63 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  43.71 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  41.56 
 
 		 371 aa  265  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  43.71 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  41.16 
 
 		 371 aa  265  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  41.56 
 
 		 371 aa  265  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  41.56 
 
 		 371 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  41.56 
 
 		 371 aa  263  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  41.3 
 
 		 371 aa  263  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  37.82 
 
 		 395 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  42.45 
 
 		 370 aa  263  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  41.11 
 
 		 407 aa  262  6.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  40.9 
 
 		 415 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  39.23 
 
 		 410 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  40.59 
 
 		 369 aa  260  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  41.94 
 
 		 413 aa  259  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  41.31 
 
 		 466 aa  259  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3219  glucose sorbosone dehydrogenase  45.73 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  38.59 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2526  glucose sorbosone dehydrogenase  43.25 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000347403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  37.31 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1774  glucose sorbosone dehydrogenase  45.14 
 
 		 402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2262  glucose dehydrogenase  39.59 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  42.32 
 
 		 374 aa  253  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  39.79 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  41.95 
 
 		 391 aa  252  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1619  glucose sorbosone dehydrogenase  41.09 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  40.92 
 
 		 372 aa  249  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  40.12 
 
 		 408 aa  248  9e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  41.87 
 
 		 485 aa  243  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>