236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0955 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  63.01 
 
 		 252 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  60.78 
 
 		 274 aa  325  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  63.95 
 
 		 252 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  56.85 
 
 		 252 aa  261  8.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  55.87 
 
 		 265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  56.37 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  55.87 
 
 		 265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  46.25 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  42.74 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  44.71 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  44.35 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  44.02 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  40.48 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  40.84 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  40.3 
 
 		 260 aa  195  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  40.82 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  42.62 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  41.03 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  41.41 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  45.33 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  42.26 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  39.29 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  38.84 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  40.18 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  39.41 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  39.41 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  37.89 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  35.54 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  35.46 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  34.42 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.54 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  34.84 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  36.06 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  34.29 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  33.48 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  35.22 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  35.22 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  32.97 
 
 		 205 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  31.71 
 
 		 245 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  29.86 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  34.94 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  30.94 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  26.61 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  38.22 
 
 		 273 aa  98.6  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  29.52 
 
 		 535 aa  98.6  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  26.78 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1504  DSBA oxidoreductase  35.54 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1783  DSBA oxidoreductase  35.54 
 
 		 228 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  31.22 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  32.3 
 
 		 222 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 		 235 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  35.5 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0607  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 		 232 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.574613 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  32.92 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  35.5 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  33.52 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  26.59 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  30.09 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 210 aa  92  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  28.17 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  27.53 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  26.21 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  29.25 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 		 197 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  33.88 
 
 		 211 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  32 
 
 		 198 aa  89  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  33.09 
 
 		 209 aa  85.9  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  28.81 
 
 		 236 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  28.82 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  30.63 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  32.19 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  28.3 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  29.63 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7384  DSBA oxidoreductase  30.82 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  29.63 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  33.33 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  29.63 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  29.63 
 
 		 207 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  29.63 
 
 		 207 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  30.36 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>