257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3472 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3472  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
183 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.353305 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0737  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.8 
 
 
183 aa  316  1e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0826  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.26 
 
 
183 aa  313  7e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0680706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04280  ATP-dependent protease peptidase subunit  92.35 
 
 
183 aa  297  6e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  72 
 
 
187 aa  246  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.57 
 
 
177 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.29 
 
 
182 aa  241  5e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.71 
 
 
182 aa  240  9e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.67 
 
 
176 aa  236  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  68 
 
 
183 aa  235  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.93 
 
 
174 aa  234  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.93 
 
 
174 aa  234  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.93 
 
 
174 aa  234  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.51 
 
 
176 aa  234  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.43 
 
 
178 aa  234  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.39 
 
 
181 aa  234  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.56 
 
 
199 aa  232  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.77 
 
 
183 aa  231  6e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.44 
 
 
172 aa  231  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.77 
 
 
178 aa  231  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 
176 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  70.35 
 
 
176 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 
176 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 
176 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 
176 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 
176 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 
176 aa  230  7.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 
176 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  70.35 
 
 
176 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.25 
 
 
190 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.02 
 
 
176 aa  229  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.98 
 
 
186 aa  229  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.22 
 
 
193 aa  230  1e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 
176 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 
176 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 
176 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 
176 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.5 
 
 
184 aa  229  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 
176 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.43 
 
 
179 aa  228  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.96 
 
 
184 aa  228  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.71 
 
 
204 aa  228  4e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.97 
 
 
176 aa  228  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.29 
 
 
178 aa  228  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.77 
 
 
176 aa  228  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.89 
 
 
184 aa  227  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.09 
 
 
182 aa  227  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.71 
 
 
181 aa  227  9e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.19 
 
 
176 aa  227  9e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.89 
 
 
184 aa  226  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.89 
 
 
184 aa  226  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.44 
 
 
185 aa  226  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.6 
 
 
174 aa  226  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 
187 aa  226  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.19 
 
 
176 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.02 
 
 
176 aa  225  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.97 
 
 
176 aa  225  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  62.86 
 
 
180 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.44 
 
 
174 aa  224  6e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.28 
 
 
174 aa  224  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.54 
 
 
184 aa  224  7e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.6 
 
 
176 aa  223  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 
174 aa  223  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45380  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.6 
 
 
180 aa  222  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479981  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.7 
 
 
174 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.28 
 
 
176 aa  222  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.91 
 
 
181 aa  222  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.7 
 
 
174 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.7 
 
 
174 aa  220  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.8 
 
 
181 aa  220  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.63 
 
 
194 aa  220  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  64 
 
 
182 aa  220  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.7 
 
 
172 aa  220  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2367  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.14 
 
 
179 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121979  hitchhiker  0.00000525467 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.71 
 
 
196 aa  219  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.8 
 
 
193 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.42 
 
 
176 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.56 
 
 
184 aa  219  1.9999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.25 
 
 
181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00724  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.6 
 
 
183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.42 
 
 
176 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.79 
 
 
183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.42 
 
 
176 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.9 
 
 
175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2747  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.14 
 
 
173 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.57 
 
 
186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.09 
 
 
185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 
176 aa  218  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.71 
 
 
184 aa  218  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.84 
 
 
176 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 
174 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  64 
 
 
186 aa  217  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0395  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.42 
 
 
176 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3837  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 
178 aa  217  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.552553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5140  heat shock protein HslV  68.42 
 
 
176 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.57 
 
 
188 aa  216  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.91 
 
 
185 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5790  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.05 
 
 
182 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66770  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.05 
 
 
177 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>