More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3409 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  100 
 
 		 183 aa  362  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  61.18 
 
 		 204 aa  187  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  54.81 
 
 		 172 aa  144  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  52.53 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  54.55 
 
 		 196 aa  137  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  50.74 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  51.88 
 
 		 194 aa  130  9e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  48.59 
 
 		 446 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  48.06 
 
 		 377 aa  113  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  39.57 
 
 		 223 aa  99.8  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  45.76 
 
 		 174 aa  98.6  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  43.59 
 
 		 238 aa  97.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  40.15 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  41.98 
 
 		 392 aa  85.1  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73200  hypothetical protein  46.96 
 
 		 169 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  44.83 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3990  peptidase M23B  41.53 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  36.72 
 
 		 348 aa  79  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3569  peptidase M23B  37.8 
 
 		 328 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4699  M24/M37 family peptidase  38.58 
 
 		 327 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0776348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0123  peptidase, M23/M37 family  38.58 
 
 		 327 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0859179  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4683  M24/M37 family peptidase  37.8 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  39.81 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2907  Peptidase M23  38.89 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4797  peptidase M23B  38.58 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0231137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5110  M24/M37 family peptidase  37.8 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4841  M24/M37 family peptidase  37.8 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.024057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4760  peptidase M23B  38.16 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  38.89 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5077  peptidase, M23/M37 family  37.8 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5206  M23/37 family peptidase  37.8 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5115  peptidase, M23/M37 family  37.8 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000714252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5117  peptidase, M23/M37 family  37.8 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0435  Peptidase M23  38.46 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  38.89 
 
 		 457 aa  74.3  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  38.89 
 
 		 457 aa  74.3  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0288  peptidase M23B  36.15 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254683  hitchhiker  0.00000000102715 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  35.07 
 
 		 390 aa  72.4  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1343  peptidase M23B  35 
 
 		 271 aa  71.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0403  peptidase M23B  40 
 
 		 170 aa  72  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00242182  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3731  peptidase M23B  39.32 
 
 		 170 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0375329  unclonable  0.0000231943 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  38.24 
 
 		 353 aa  71.6  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0288  peptidase M23B  39.32 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00195161  decreased coverage  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4420  M24/M37 family peptidase  37.39 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  41.75 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  36.22 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0305  Peptidase M23  39.13 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0293  peptidase M23B  39.13 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000339642  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  41.75 
 
 		 420 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  41.75 
 
 		 421 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  41.75 
 
 		 400 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  41.75 
 
 		 421 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  41.75 
 
 		 425 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  41 
 
 		 499 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0300  peptidase M23B  38.26 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0390881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  41.75 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  30.4 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  37.25 
 
 		 389 aa  67  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  30.4 
 
 		 477 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  36.89 
 
 		 449 aa  67  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  40.78 
 
 		 467 aa  66.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  32.71 
 
 		 388 aa  65.9  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0301  peptidase M23B  37.39 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  37.74 
 
 		 441 aa  65.5  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  34.59 
 
 		 512 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  34.59 
 
 		 471 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  34.59 
 
 		 472 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  35.92 
 
 		 503 aa  64.3  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  34.59 
 
 		 470 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  34.59 
 
 		 509 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  34.58 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  33.64 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  36.89 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  33.33 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  30.97 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  34.31 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  33.33 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1627  M24/M37 family peptidase  32.09 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  35.11 
 
 		 517 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0813  peptidase M23B  37.86 
 
 		 548 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  36.89 
 
 		 513 aa  63.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  33.33 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  25 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  38.2 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  38.24 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  33.64 
 
 		 386 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  33.12 
 
 		 345 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  34.35 
 
 		 271 aa  61.6  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  42.7 
 
 		 523 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  29.01 
 
 		 569 aa  61.6  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3437  Peptidase M23  37.96 
 
 		 296 aa  61.6  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112257  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  36.17 
 
 		 741 aa  61.6  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  38.61 
 
 		 484 aa  60.8  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  34.43 
 
 		 423 aa  60.8  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  36.63 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  34.51 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  37.08 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  35.24 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  35.37 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>