More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1058 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1058  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  340  8e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2104  GCN5-related N-acetyltransferase  69.62 
 
 
169 aa  230  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0346868 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3667  GCN5-related N-acetyltransferase  56.1 
 
 
167 aa  186  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  45.12 
 
 
176 aa  136  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1050  acetyltransferase  45.68 
 
 
186 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0753  acetyltransferase  43.36 
 
 
172 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  40.4 
 
 
207 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0755  acetyltransferase  37.35 
 
 
175 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2605  hypothetical protein  34.57 
 
 
201 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.463816  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0751  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 
164 aa  101  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0752  GCN5-related N-acetyltransferase  41.1 
 
 
170 aa  101  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0754  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 
179 aa  101  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0179  GCN5-related N-acetyltransferase  45.06 
 
 
186 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0352  acetyltransferase  37.93 
 
 
177 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  39.88 
 
 
176 aa  99  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332564  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  38.99 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.988966  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1052  acetyltransferase  36.59 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2713  putative acetyltransferase  36.59 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.699108  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0350  hypothetical protein  33.13 
 
 
201 aa  94.7  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0317  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1051  hypothetical protein  42.33 
 
 
176 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2712  GCN5-related N-acetyltransferase  42.33 
 
 
176 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.757846  normal  0.0335255 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0177  acetyltransferase  34.57 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2711  GCN5-related N-acetyltransferase  45.68 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.764957  normal  0.0336934 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0178  GCN5-related N-acetyltransferase  39.26 
 
 
176 aa  84.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1187  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
171 aa  84  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  36.13 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350892  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  35.25 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4585  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
178 aa  77.4  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.249566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  32.68 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2827  hypothetical protein  36.55 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  32.87 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1793  hypothetical protein  31.65 
 
 
190 aa  70.9  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.53536  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
190 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4082  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4498  acetyltransferase, GNAT family  28.31 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4484  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.31 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4446  acetyltransferase  28.31 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.949941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4098  acetyltransferase  28.31 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4109  acetyltransferase  28.31 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0244  GNAT family acetyltransferase  30.46 
 
 
178 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4593  acetyltransferase  28.31 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  35.76 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4445  acetyltransferase, GNAT family  28.31 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3625  hypothetical protein  30.26 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4735  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43909  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  31.29 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0752  acetyltransferase, GNAT family  27.11 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6557  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  34.31 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  31.08 
 
 
188 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  32 
 
 
189 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3081  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0037  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1431  acetyltransferase  33.78 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  32.87 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4261  acetyltransferase  28.31 
 
 
167 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
178 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
178 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
183 aa  61.6  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.215241  normal  0.0203096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
178 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
178 aa  61.2  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6271  GCN5-related N-acetyltransferase  29.24 
 
 
184 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7056  GCN5-related N-acetyltransferase  31.14 
 
 
179 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.12 
 
 
359 aa  60.5  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  31.41 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3269  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2217  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0249063  normal  0.199157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  31.17 
 
 
189 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  38.37 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
178 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
187 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  38.37 
 
 
182 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 
181 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1193  acetyltransferase  31.54 
 
 
207 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
175 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1115  acetyltransferase  31.54 
 
 
207 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 
170 aa  58.2  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
178 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 
178 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2397  acetyltransferase  31.54 
 
 
336 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
183 aa  57.4  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
191 aa  57.4  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0671  acetyltransferase  30.87 
 
 
204 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300648  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1758  acetyltransferase  30.87 
 
 
225 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0794  acetyltransferase  30.87 
 
 
204 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>