159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3546 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3546  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 378 aa  780    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1400  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.55 
 
 		 403 aa  249  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615384  normal  0.500213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3137  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.23 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.54 
 
 		 478 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6595  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.37 
 
 		 553 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.775034 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.94 
 
 		 563 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.15 
 
 		 549 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.66 
 
 		 565 aa  157  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40 
 
 		 549 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  33.86 
 
 		 661 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.14 
 
 		 535 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.59 
 
 		 566 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.87 
 
 		 547 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  38.7 
 
 		 546 aa  150  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  37.89 
 
 		 563 aa  150  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.68 
 
 		 559 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.57 
 
 		 560 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.91 
 
 		 544 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.65 
 
 		 560 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.73 
 
 		 540 aa  142  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2146  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.38 
 
 		 558 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  37.04 
 
 		 536 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1831  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.94 
 
 		 542 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1889  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.94 
 
 		 558 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.362103 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1327  hypothetical protein  35.9 
 
 		 512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.592833  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  36.89 
 
 		 513 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02710  hypothetical protein  36.41 
 
 		 530 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  32.79 
 
 		 530 aa  139  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.15 
 
 		 549 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 624 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  35.56 
 
 		 563 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  36.8 
 
 		 502 aa  136  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  34.3 
 
 		 558 aa  135  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1615  cell wall degradation protein  34.63 
 
 		 513 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.12409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.65 
 
 		 625 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2377  hypothetical protein  33.47 
 
 		 483 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0887  hypothetical protein  34.48 
 
 		 524 aa  133  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  34.82 
 
 		 598 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 521 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  32.56 
 
 		 568 aa  132  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.13 
 
 		 629 aa  132  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 521 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  33.92 
 
 		 615 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.92 
 
 		 615 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  34.65 
 
 		 557 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  33.92 
 
 		 615 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.73 
 
 		 525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315438  normal  0.0441683 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  33.92 
 
 		 615 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0671  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.48 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  33.92 
 
 		 615 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2451  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.68 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000544854  normal  0.511504 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  33.92 
 
 		 615 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  33.92 
 
 		 615 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  34.26 
 
 		 546 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.26 
 
 		 546 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  33.92 
 
 		 611 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  33.92 
 
 		 615 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 654 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.96 
 
 		 599 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.28 
 
 		 521 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  34.36 
 
 		 563 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30 
 
 		 543 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1072  hypothetical protein  36.73 
 
 		 475 aa  129  9.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.83 
 
 		 461 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  34.36 
 
 		 607 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  33.48 
 
 		 615 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  35.37 
 
 		 618 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  35.37 
 
 		 596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  35.37 
 
 		 618 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.63 
 
 		 473 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  33.48 
 
 		 606 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.65 
 
 		 525 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  33.48 
 
 		 615 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  33.48 
 
 		 615 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  33.48 
 
 		 616 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.61 
 
 		 670 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  34.54 
 
 		 561 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  32.59 
 
 		 576 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.46 
 
 		 533 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1957  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.22 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.732042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  33.93 
 
 		 564 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.04 
 
 		 484 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  33.62 
 
 		 613 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1501  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.4 
 
 		 498 aa  123  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  32.3 
 
 		 540 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.46 
 
 		 533 aa  123  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6864  hypothetical protein  30.66 
 
 		 702 aa  123  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337654  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  32.14 
 
 		 575 aa  122  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.57 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.96 
 
 		 472 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.68 
 
 		 775 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.73 
 
 		 516 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  31.35 
 
 		 572 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  31.35 
 
 		 656 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.07 
 
 		 668 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  32.68 
 
 		 811 aa  119  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  33.07 
 
 		 554 aa  119  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  30.89 
 
 		 537 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.87 
 
 		 540 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.63 
 
 		 500 aa  119  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0274269 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>