53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2905 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  551  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  40.09 
 
 
271 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  27.57 
 
 
281 aa  96.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0711  hypothetical protein  25.93 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  25.89 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  27.27 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  36.8 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  29.85 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44590  hypothetical protein  31.51 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0494  putative lipoprotein  32.81 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1227  hypothetical protein  19.63 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.219903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0546  putative lipoprotein  28.12 
 
 
248 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3541  hypothetical protein  27.27 
 
 
262 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  33.08 
 
 
274 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1623  hypothetical protein  30.3 
 
 
232 aa  62.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2036  hypothetical protein  24.31 
 
 
261 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4974  lipoprotein, putative  27.34 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  29.69 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65720  putative lipoprotein  26.88 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5701  lipoprotein  26.88 
 
 
248 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2239  hypothetical protein  27.07 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16446  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0593  hypothetical protein  31.09 
 
 
335 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000608871  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1108  endo-1,4-beta-xylanase-like protein  29.23 
 
 
258 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.591273 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  26.32 
 
 
370 aa  56.2  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  24.26 
 
 
452 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4920  putative lipoprotein  24.8 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94223  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  25.31 
 
 
361 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2639  hypothetical protein  24.51 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4796  hypothetical protein  24.8 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  20.92 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  30.09 
 
 
315 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4973  lipoprotein  24 
 
 
248 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  20.29 
 
 
236 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0805  hypothetical protein  31.06 
 
 
264 aa  52.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4712  lipoprotein  23.2 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1278  hypothetical protein  24.7 
 
 
227 aa  52.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00544621  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2095  hypothetical protein  24.71 
 
 
378 aa  52.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1924  hypothetical protein  23.43 
 
 
263 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139586  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3020  hypothetical protein  23.57 
 
 
258 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  28.46 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  26.98 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1308  hypothetical protein  27.78 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  24.49 
 
 
247 aa  47  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12011  immunogenic protein mpt64  23.48 
 
 
228 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  27.92 
 
 
386 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  23.6 
 
 
384 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1942  copper amine oxidase domain protein  21.26 
 
 
480 aa  42.4  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2092  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  23.13 
 
 
244 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  25.37 
 
 
247 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  25.37 
 
 
247 aa  42.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  25.37 
 
 
247 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  27.82 
 
 
247 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4267  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  23.38 
 
 
244 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.54877  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>