17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2239 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2239  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  551  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16446  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2639  hypothetical protein  72.56 
 
 
276 aa  388  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1924  hypothetical protein  59.77 
 
 
263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139586  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3020  hypothetical protein  57.87 
 
 
258 aa  300  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2036  hypothetical protein  58.54 
 
 
261 aa  284  9e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3541  hypothetical protein  56 
 
 
262 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1755  hypothetical protein  57.26 
 
 
257 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.147362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1706  hypothetical protein  33.56 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0984595  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  26.45 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1111  hypothetical protein  35.48 
 
 
268 aa  55.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254819  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  27.03 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  26.99 
 
 
333 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  21.97 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0714  hypothetical protein  29.8 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  25.87 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2095  hypothetical protein  27.97 
 
 
378 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  28.12 
 
 
361 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>