10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1755 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1755  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.147362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3020  hypothetical protein  63.86 
 
 		 258 aa  327  9e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1924  hypothetical protein  59.85 
 
 		 263 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139586  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2036  hypothetical protein  57.83 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3541  hypothetical protein  57.66 
 
 		 262 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2239  hypothetical protein  55.12 
 
 		 270 aa  275  5e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2639  hypothetical protein  53.54 
 
 		 276 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1706  hypothetical protein  35.51 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0984595  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1111  hypothetical protein  32.8 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254819  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  26.8 
 
 		 370 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>