21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3541 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3541  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2036  hypothetical protein  76.47 
 
 		 261 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1924  hypothetical protein  75.1 
 
 		 263 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139586  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3020  hypothetical protein  61.09 
 
 		 258 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1755  hypothetical protein  58.09 
 
 		 257 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.147362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2239  hypothetical protein  56 
 
 		 270 aa  277  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2639  hypothetical protein  52.21 
 
 		 276 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1111  hypothetical protein  36.97 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  27.27 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  27.75 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1706  hypothetical protein  32.09 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0984595  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  23.81 
 
 		 370 aa  52  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  27.78 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0714  hypothetical protein  32.61 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2095  hypothetical protein  25.14 
 
 		 378 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  26.76 
 
 		 333 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1587  hypothetical protein  22.16 
 
 		 412 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1108  endo-1,4-beta-xylanase-like protein  25.56 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.591273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  28.35 
 
 		 361 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  26.01 
 
 		 386 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0730  hypothetical protein  24.26 
 
 		 322 aa  42.4  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000190303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>