134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19060 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  265  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  76.15 
 
 
132 aa  212  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  62.69 
 
 
135 aa  144  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  49.23 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  46.92 
 
 
116 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  46.92 
 
 
116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  46.92 
 
 
116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  47.29 
 
 
116 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  49.19 
 
 
228 aa  105  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  44.19 
 
 
116 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  49.62 
 
 
253 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  47.54 
 
 
245 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.38 
 
 
126 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  45.97 
 
 
245 aa  92  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  43.85 
 
 
117 aa  90.9  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.69 
 
 
124 aa  85.9  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  44.64 
 
 
239 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  44.35 
 
 
240 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  38.46 
 
 
123 aa  82  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  40.3 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  39.69 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  39.69 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  36.84 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.23 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.46 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  38.93 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  38.64 
 
 
119 aa  73.6  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  53.42 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  39.69 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.23 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  42.86 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  37.01 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  38.97 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  52.94 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  37.6 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.43 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  37.5 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  43.33 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.31 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.31 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.31 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1410  hypothetical protein  54.1 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406941  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  39.23 
 
 
115 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1116  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.22 
 
 
238 aa  67  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  36.84 
 
 
150 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  39.13 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  36.22 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  39.53 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  35.97 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  48.1 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.02 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  39.53 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6182  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.69 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  34.03 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  34.11 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1108  hypothetical protein  39.76 
 
 
230 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  52 
 
 
335 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.56 
 
 
129 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  35.14 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  33.58 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  47.5 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  37.5 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06250  hypothetical protein  38.52 
 
 
242 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.938865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  46.15 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  38.76 
 
 
127 aa  57.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  35.62 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  34.38 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  41 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  34.92 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  34.9 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  32.67 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.81 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  34.67 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  31.82 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.77 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  34.31 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2041  hypothetical protein  35.43 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  36.31 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.21 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  33.59 
 
 
234 aa  54.7  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  34.35 
 
 
129 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05900  hypothetical protein  47.89 
 
 
63 aa  54.3  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  32.24 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  34.25 
 
 
153 aa  53.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  34.21 
 
 
124 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3076  hypothetical protein  32.19 
 
 
146 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.4 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.743338  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  42.31 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  34.55 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  30.2 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.56 
 
 
119 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.13 
 
 
218 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3282  hypothetical protein  39.02 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  33.06 
 
 
118 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1825  hypothetical protein  36.28 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00267631  normal  0.075549 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>