More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17650 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1685  AAA ATPase central domain protein  72.95 
 
 		 478 aa  636    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17650  Recombination protein MgsA  100 
 
 		 490 aa  966    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.397333  normal  0.0704378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  78.97 
 
 		 473 aa  650    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  69.61 
 
 		 484 aa  621  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1356  AAA ATPase central domain protein  69.18 
 
 		 464 aa  607  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.873359 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  66.52 
 
 		 461 aa  568  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  67.18 
 
 		 456 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  60.21 
 
 		 446 aa  531  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  64.18 
 
 		 465 aa  529  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  61.52 
 
 		 448 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  60.26 
 
 		 456 aa  527  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2283  recombination factor protein RarA  64.74 
 
 		 474 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243633  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  60.81 
 
 		 463 aa  522  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  59.19 
 
 		 429 aa  524  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2019  recombination factor protein RarA  64.59 
 
 		 466 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000217538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  60.46 
 
 		 502 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  60.21 
 
 		 519 aa  511  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  59.83 
 
 		 477 aa  511  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  58.73 
 
 		 463 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  59.23 
 
 		 462 aa  511  1e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  62.34 
 
 		 456 aa  511  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  60.09 
 
 		 445 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  60.09 
 
 		 445 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  60.09 
 
 		 445 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  58.68 
 
 		 445 aa  500  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  59.66 
 
 		 465 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  60.72 
 
 		 448 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  61.54 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  57.94 
 
 		 459 aa  496  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  59.79 
 
 		 436 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  58.3 
 
 		 494 aa  495  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  61.11 
 
 		 441 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  59.05 
 
 		 460 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  58.47 
 
 		 452 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  56.17 
 
 		 500 aa  486  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  57.2 
 
 		 436 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  58.44 
 
 		 457 aa  451  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  45.47 
 
 		 450 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12450  Recombination protein MgsA  61.87 
 
 		 499 aa  428  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101973  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  44.31 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  47.19 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  43.18 
 
 		 441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  46.57 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  46.55 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  51.05 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  46.49 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  46.6 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  49.47 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  47.26 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  46.98 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  44.4 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  45.15 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  46.48 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  45.15 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  46.56 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  45.36 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  44.21 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  43.42 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  43.63 
 
 		 457 aa  373  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  43.33 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  48.12 
 
 		 446 aa  375  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  44.26 
 
 		 457 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  46.65 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  47.76 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  41.7 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  48.4 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  46.1 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  45.75 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  47.59 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  44.33 
 
 		 447 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  46.52 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  43.51 
 
 		 444 aa  364  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  47.45 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  45.82 
 
 		 457 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  44.56 
 
 		 422 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  42.09 
 
 		 441 aa  362  1e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  45.53 
 
 		 461 aa  361  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 455 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  44.33 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  44.21 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  42.24 
 
 		 437 aa  360  4e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  43.2 
 
 		 439 aa  359  8e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  43.9 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  44.38 
 
 		 463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  43.9 
 
 		 436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  43.9 
 
 		 436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  44.4 
 
 		 447 aa  355  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  45.4 
 
 		 505 aa  355  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  43.47 
 
 		 436 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  41.16 
 
 		 431 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  44.4 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  41.72 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  43.47 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  43.3 
 
 		 447 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>