More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14090 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  100 
 
 		 82 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  84.15 
 
 		 82 aa  136  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  84.15 
 
 		 82 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  79.27 
 
 		 82 aa  128  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  75.31 
 
 		 82 aa  124  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  74.68 
 
 		 81 aa  120  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  71.6 
 
 		 82 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  72.15 
 
 		 81 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  73.42 
 
 		 81 aa  113  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  70.89 
 
 		 81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  63.1 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 84 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  68.49 
 
 		 81 aa  98.6  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  61.04 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  64.63 
 
 		 81 aa  97.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 79 aa  96.7  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 80 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  60.98 
 
 		 82 aa  94.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  56.41 
 
 		 79 aa  93.6  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  57.32 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  56.41 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  54.32 
 
 		 82 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 82 aa  88.6  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  55.13 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  55.13 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  55.13 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 79 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  58.67 
 
 		 80 aa  87.8  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  55.13 
 
 		 99 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 82 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 79 aa  87  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  59.46 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  48.78 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  54.24 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  46.67 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  44.29 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  44.29 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  37.18 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  42.25 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  42.25 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  46.05 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  46.05 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  46.05 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  46.27 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  47.89 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  47.89 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  46.48 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  47.89 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  42.25 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  44.93 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  40.85 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  39.47 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  40.85 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  36.99 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  40 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  42.25 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  43.06 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  39.71 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  38.67 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  38.67 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  38.67 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  38.67 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  40.28 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  41.79 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  35.21 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  40.51 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  42.25 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  43.84 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  42.25 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  38.57 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  38.27 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  36.62 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  40.28 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  36 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  38.36 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  41.79 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  38.03 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  41.89 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  38.67 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  38.03 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  38.03 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  38.03 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  38.03 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  38.03 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  38.03 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  38.03 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  38.03 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  38.03 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  33.78 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>