28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0667 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  69.96 
 
 		 240 aa  325  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  67.39 
 
 		 234 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  69.1 
 
 		 233 aa  299  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  55.75 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0653  hypothetical protein  54.21 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  54.93 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001203  hypothetical protein  53.52 
 
 		 227 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  49.77 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  33.01 
 
 		 249 aa  105  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3279  hypothetical protein  33.97 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0613272 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04991  hypothetical protein  32.69 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3418  hypothetical protein  36.23 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0668  hypothetical protein  33.49 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001204  hypothetical protein  32.21 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0486  hypothetical protein  34.58 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3702  hypothetical protein  31.46 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.257264  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0652  hypothetical protein  30.41 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0290  hypothetical protein  31.88 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0219  hypothetical protein  31.73 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49342  predicted protein  29.11 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04060  elongation factor Ts  31.71 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3778  hypothetical protein  32.87 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  27.8 
 
 		 513 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2819  hypothetical protein  30.71 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4305  hypothetical protein  25.9 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38008  predicted protein  26.98 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>