256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3158 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 326 aa  664    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  96.59 
 
 		 326 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  91.74 
 
 		 327 aa  616  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  82.46 
 
 		 327 aa  547  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  64.1 
 
 		 311 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  64.74 
 
 		 312 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  64.74 
 
 		 320 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  64.1 
 
 		 311 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  63.67 
 
 		 311 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  54.92 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  51.13 
 
 		 319 aa  294  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  52.79 
 
 		 306 aa  291  8e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  51.1 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  49.21 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0730  2-dehydropantoate 2-reductase  49.38 
 
 		 322 aa  280  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  52.61 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  40.66 
 
 		 296 aa  195  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  38.69 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  40.66 
 
 		 296 aa  189  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  35.6 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  36.72 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  36.84 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  37.79 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  34.87 
 
 		 302 aa  153  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  35.74 
 
 		 306 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  36.63 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  36.46 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  34.84 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  33.54 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  35.15 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  34.52 
 
 		 303 aa  136  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  34.27 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586836 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  33.92 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  34.26 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13400  2-dehydropantoate 2-reductase  35.42 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 		 303 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  34.38 
 
 		 303 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 		 303 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  34.49 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 		 305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  32.5 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0937  2-dehydropantoate 2-reductase  36.81 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  32.07 
 
 		 312 aa  123  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0272  2-dehydropantoate 2-reductase  35.06 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4059  2-dehydropantoate 2-reductase  29.65 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00247246  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3771  2-dehydropantoate 2-reductase  29.65 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  29.88 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3966  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3973  2-dehydropantoate 2-reductase  28.8 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000131427  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  30.89 
 
 		 309 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  29.3 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3679  2-dehydropantoate 2-reductase  29.3 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.953522  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2032  2-dehydropantoate 2-reductase  29.53 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3935  2-dehydropantoate 2-reductase  29.02 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.665009 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3662  2-dehydropantoate 2-reductase  29.02 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000935391  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3747  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  29.37 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10586  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06390)  29.03 
 
 		 424 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2570  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 		 296 aa  93.6  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1220  2-dehydropantoate 2-reductase  27.88 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00748883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 306 aa  90.1  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 313 aa  89.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  30.25 
 
 		 307 aa  89.4  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  32.52 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  24.68 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  26.62 
 
 		 309 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  26.3 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54699  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  27.73 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  27.63 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0390953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  28.85 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  29.03 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  33.67 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  27.96 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1363  2-dehydropantoate 2-reductase  26.89 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00078431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  27.48 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>