296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3281 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3281  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 240 aa  494  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0839  phosphoglycerate mutase  96.25 
 
 		 240 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3183  phosphoglycerate mutase  96.25 
 
 		 240 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1031  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  69.05 
 
 		 249 aa  334  7e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1008  phosphoglycerate mutase  65.32 
 
 		 243 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  64.52 
 
 		 243 aa  328  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  65.16 
 
 		 239 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  65.02 
 
 		 241 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  64.75 
 
 		 239 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  41.63 
 
 		 215 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  40.51 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  42.79 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  39.32 
 
 		 203 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  36.11 
 
 		 208 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.54 
 
 		 191 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  35.05 
 
 		 190 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 190 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 217 aa  102  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  31.92 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  34.02 
 
 		 194 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  31.19 
 
 		 189 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 190 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  33.16 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  30.09 
 
 		 204 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  31.28 
 
 		 196 aa  92.4  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  33.51 
 
 		 194 aa  92  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  32.63 
 
 		 188 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 201 aa  91.7  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 188 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  29.2 
 
 		 204 aa  88.2  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.98 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  34.02 
 
 		 189 aa  86.3  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  32.27 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  27.03 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  27.35 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.64 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.55 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.41 
 
 		 198 aa  72  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  37.16 
 
 		 201 aa  71.6  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  26.46 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1824  Phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.87879e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.32 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.18 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30.07 
 
 		 214 aa  67  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  28.93 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  28.93 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  27.92 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.43 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  28.43 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  28.43 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  28.43 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  28.43 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  28.08 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.73 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.73 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  28.08 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  29.18 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  27.59 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3656  phosphoglycerate mutase family protein  24.77 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  28 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  27.46 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  27.59 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  25.89 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  28.92 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  27.18 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  29.44 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  26.04 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 370 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  26.53 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  27.18 
 
 		 205 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  24.12 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.51 
 
 		 442 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.12 
 
 		 444 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  22.82 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.02 
 
 		 443 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  26.46 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  27.5 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  23.91 
 
 		 191 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  27.74 
 
 		 190 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>