42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2289 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 1069 aa  2191    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  42.91 
 
 		 970 aa  213  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  42.91 
 
 		 693 aa  211  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  43.36 
 
 		 1193 aa  200  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  44.3 
 
 		 601 aa  137  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  50.76 
 
 		 812 aa  135  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2821  hypothetical protein  30.1 
 
 		 631 aa  124  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6589  hypothetical protein  32.66 
 
 		 436 aa  119  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  43.15 
 
 		 1236 aa  109  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  44.2 
 
 		 1424 aa  108  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  40.69 
 
 		 1479 aa  108  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  40.29 
 
 		 1206 aa  106  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  40 
 
 		 2142 aa  101  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  38.06 
 
 		 1193 aa  98.6  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  39.58 
 
 		 1295 aa  95.9  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  39.84 
 
 		 693 aa  94.7  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  37.31 
 
 		 1687 aa  87.4  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  35.26 
 
 		 1465 aa  85.1  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  30.61 
 
 		 1455 aa  85.1  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  36.09 
 
 		 1392 aa  84.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.29 
 
 		 1201 aa  78.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  31.78 
 
 		 1108 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1842  hyaluronoglucosaminidase domain-containing protein  40.19 
 
 		 248 aa  67.4  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2846  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  36.84 
 
 		 624 aa  66.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1186  hypothetical protein  32.64 
 
 		 582 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292317  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  36.27 
 
 		 636 aa  63.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1808  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  31.62 
 
 		 413 aa  63.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145973  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1179  hypothetical protein  32.52 
 
 		 655 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580087  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2814  hypothetical protein  32.52 
 
 		 655 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  27.61 
 
 		 677 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1438  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  31.51 
 
 		 639 aa  56.6  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  38.32 
 
 		 850 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  32.2 
 
 		 631 aa  55.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  27.54 
 
 		 658 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1338  hypothetical protein  22.69 
 
 		 658 aa  53.5  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.997364  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3814  glycoside hydrolase family 31  35.29 
 
 		 1119 aa  53.5  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  34.23 
 
 		 732 aa  52.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0480  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  31.65 
 
 		 794 aa  52  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.133222 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.95 
 
 		 857 aa  52  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28 
 
 		 985 aa  48.5  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  33.75 
 
 		 589 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  32.04 
 
 		 572 aa  44.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>