29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2274 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  100 
 
 		 602 aa  1238    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  44.46 
 
 		 595 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  24.86 
 
 		 580 aa  124  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  24.31 
 
 		 583 aa  121  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  23.31 
 
 		 565 aa  98.6  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  24.72 
 
 		 571 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  26.61 
 
 		 347 aa  92.8  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  24.07 
 
 		 573 aa  88.6  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0282  AAA ATPase  22.43 
 
 		 378 aa  76.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  22.4 
 
 		 572 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  29.37 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  22.63 
 
 		 680 aa  72  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  25.38 
 
 		 591 aa  62  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  24.52 
 
 		 593 aa  61.6  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  24.91 
 
 		 634 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.08 
 
 		 708 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  23.89 
 
 		 643 aa  51.6  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  26.39 
 
 		 669 aa  51.2  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  41.79 
 
 		 623 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2495  hypothetical protein  23.53 
 
 		 630 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  31.86 
 
 		 586 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  25.69 
 
 		 597 aa  46.2  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0565  hypothetical protein  32.04 
 
 		 556 aa  45.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  28.05 
 
 		 628 aa  45.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  27.05 
 
 		 584 aa  44.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  26.46 
 
 		 642 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  26.4 
 
 		 695 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  26.09 
 
 		 565 aa  44.3  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.92 
 
 		 669 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>