60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_28560 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_28560  histidine kinase  100 
 
 		 255 aa  520  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000031694  hitchhiker  0.000525882 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14220  histidine kinase  45.15 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0001  transcriptional regulator, TrmB  71.05 
 
 		 371 aa  227  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000656108  hitchhiker  0.000000126577 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0001  ATP-binding region ATPase domain protein  37.5 
 
 		 288 aa  161  9e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.557706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3217  transcriptional regulator, TrmB  32.06 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.770458  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.19 
 
 		 1301 aa  56.2  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3999  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 567 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 679 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4270  sensor histidine kinase  39.02 
 
 		 511 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 505 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  31.76 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 490 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 1568 aa  46.6  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1558  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 415 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.881718  normal  0.799024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2443  histidine kinase  34.13 
 
 		 578 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  32.43 
 
 		 551 aa  46.2  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 579 aa  45.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0915  histidine kinase  25 
 
 		 176 aa  46.2  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.932987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  32.63 
 
 		 1366 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 468 aa  45.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 556 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  32.39 
 
 		 300 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 594 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2297  histidine kinase  29.06 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  28.06 
 
 		 613 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 150 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.71 
 
 		 155 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 		 837 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 920 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  27.27 
 
 		 511 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 413 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 1236 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  28.41 
 
 		 927 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 530 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1181 aa  43.5  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0305  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 754 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  34.85 
 
 		 833 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0967  histidine kinase  25.78 
 
 		 475 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1680  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 961 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  30.93 
 
 		 599 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0803  histidine kinase  26.21 
 
 		 718 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571523  hitchhiker  0.00843936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  24.59 
 
 		 1161 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1213  sensor histidine kinase KdpD  30.68 
 
 		 900 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0882  transcriptional regulator, DeoR family  38.71 
 
 		 277 aa  42.4  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.262564  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4427  sensor histidine kinase  34.21 
 
 		 418 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 		 1045 aa  42.4  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 469 aa  42.4  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.370323  normal  0.370288 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4104  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 		 557 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3829  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 475 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.821642 
 
 
-
 
NC_002978  WD1284  sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 475 aa  42.4  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7082  histidine kinase  25.71 
 
 		 461 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 364 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2120  multisensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 682 aa  42  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.39 
 
 		 1248 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0224  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 379 aa  42  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0791  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 415 aa  42  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  32.65 
 
 		 450 aa  42  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0792  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 592 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.389456  hitchhiker  0.00398352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>