127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0001 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0001  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
371 aa  749    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000656108  hitchhiker  0.000000126577 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14220  histidine kinase  65.85 
 
 
283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28560  histidine kinase  71.05 
 
 
255 aa  228  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000031694  hitchhiker  0.000525882 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0001  ATP-binding region ATPase domain protein  36.08 
 
 
288 aa  169  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.557706  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3217  transcriptional regulator, TrmB  39.58 
 
 
267 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.770458  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 
837 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
490 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 
500 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
657 aa  51.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  34.88 
 
 
311 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  29.75 
 
 
1207 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  36.62 
 
 
551 aa  50.1  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3829  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
475 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.821642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
300 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  36.62 
 
 
300 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  34.23 
 
 
1335 aa  49.7  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  37.5 
 
 
655 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2855  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
712 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0395  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
509 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
472 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
507 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 
488 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1781  signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2564  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
559 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382353  hitchhiker  0.0000221302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
655 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0191  ATPase domain-containing protein  25.57 
 
 
510 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.14 
 
 
545 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
577 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224875  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0791  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
415 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4427  sensor histidine kinase  35.9 
 
 
418 aa  47.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
500 aa  47  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0283  ATPase domain-containing protein  34.62 
 
 
411 aa  47  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143698  hitchhiker  0.000000382002 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  25.93 
 
 
542 aa  47  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1012  response regulator, histidine kinase  33.78 
 
 
578 aa  47  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
474 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0282  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
411 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000209269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3739  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
411 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0303484 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
474 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
437 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838045  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2201  multisensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
633 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0792  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
592 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.389456  hitchhiker  0.00398352 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
654 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0139  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
1066 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  32.98 
 
 
629 aa  46.6  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  23.56 
 
 
545 aa  46.6  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
1568 aa  46.2  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
465 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 
868 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  29.55 
 
 
961 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  35.14 
 
 
833 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2412  histidine kinase  26.43 
 
 
603 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0334  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.63 
 
 
149 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.03 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
978 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
468 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2369  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
793 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4686  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
498 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.226559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
510 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3609  histidine kinase  32.91 
 
 
498 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.708501  normal  0.855271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  23.26 
 
 
982 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  36.76 
 
 
736 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.7 
 
 
1162 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
502 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
423 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.149511  hitchhiker  0.00271132 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  34.74 
 
 
474 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 
608 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  hitchhiker  0.000174254 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 
763 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
862 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  37.5 
 
 
501 aa  44.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
563 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 
763 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
858 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
354 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1292  histidine kinase  34.31 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00188773  hitchhiker  0.0000922476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  36 
 
 
482 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.91 
 
 
1301 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0506  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
383 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
902 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1470  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
716 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
422 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
679 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
656 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
373 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  32.89 
 
 
656 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 
763 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0110  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.09 
 
 
415 aa  43.9  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0050254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5174  histidine kinase  34.29 
 
 
273 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
594 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  32.38 
 
 
1343 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
641 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1074  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
443 aa  43.9  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0391  sensor protein BasS/PmrB  36 
 
 
361 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
614 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.86 
 
 
1045 aa  43.9  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
418 aa  43.9  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0374  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
483 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.833635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>