79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19610 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19610  negative regulator of beta-lactamase expression  100 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611508 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  57.45 
 
 		 330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  49.57 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0344  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.27 
 
 		 309 aa  122  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  45.12 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  48.61 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.33 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  43.9 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  43.04 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  40.96 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.27 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.24 
 
 		 422 aa  55.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  31.15 
 
 		 392 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  29.82 
 
 		 387 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  38.61 
 
 		 383 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  35.44 
 
 		 383 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.24 
 
 		 315 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  42.31 
 
 		 379 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  37.84 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.86 
 
 		 433 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  40 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.3 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.37 
 
 		 391 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.79 
 
 		 77 aa  48.9  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.54 
 
 		 487 aa  48.9  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.99 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.21 
 
 		 792 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.62 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  43.33 
 
 		 762 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  45.59 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.11 
 
 		 382 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.76 
 
 		 447 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.14 
 
 		 309 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  47.17 
 
 		 540 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2786  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.03 
 
 		 587 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  41.77 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.12 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.12 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.12 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  38.16 
 
 		 396 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  44.12 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  44.12 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.12 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.12 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.12 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.56 
 
 		 395 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.9 
 
 		 440 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  44.64 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  44.26 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.56 
 
 		 395 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1644  lytic murein transglycosylase  41.07 
 
 		 407 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2906  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.71 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0939  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  41.56 
 
 		 406 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.56 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.88 
 
 		 540 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  39.13 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 562 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  39.02 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  45.1 
 
 		 430 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  45.1 
 
 		 413 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.99 
 
 		 359 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2364  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.9 
 
 		 92 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.47 
 
 		 398 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  36.51 
 
 		 2277 aa  42.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.47 
 
 		 398 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.47 
 
 		 398 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2790  lytic murein transglycosylase  40.35 
 
 		 409 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0861684  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  43.64 
 
 		 418 aa  42.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.51 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  43.64 
 
 		 413 aa  42.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.31 
 
 		 412 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.78 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  39.47 
 
 		 395 aa  42  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.33 
 
 		 531 aa  42  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  34.92 
 
 		 486 aa  42  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  31.75 
 
 		 423 aa  42  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3546  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  41.27 
 
 		 255 aa  42  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.457198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>