56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1588 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
359 aa  675    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3175  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  79.83 
 
 
363 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0853  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  63.91 
 
 
360 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1583  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  62.65 
 
 
360 aa  348  9e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474827  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  35.22 
 
 
335 aa  159  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  30.63 
 
 
391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21610  hypothetical protein  33.24 
 
 
351 aa  105  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0027  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.84 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5941  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.13 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  39.13 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  35.37 
 
 
420 aa  65.9  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.42 
 
 
605 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25300  membrane-fusion protein  39.02 
 
 
379 aa  62.8  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4070  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.16 
 
 
358 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.1 
 
 
580 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.23 
 
 
376 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.6 
 
 
408 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33580  putative peptidoglycan binding protein  32.58 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10172  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.31 
 
 
440 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0582  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.96 
 
 
405 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246879  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.66 
 
 
410 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  29.74 
 
 
358 aa  49.7  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.15 
 
 
391 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2962  hypothetical protein  42.31 
 
 
547 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.41173  hitchhiker  0.00173595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  31.25 
 
 
228 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.38 
 
 
471 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0373  hypothetical protein  30.68 
 
 
454 aa  47  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.417823  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.18 
 
 
326 aa  47  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27870  hypothetical protein  41.43 
 
 
515 aa  47  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 
593 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  42 
 
 
249 aa  46.6  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.11 
 
 
422 aa  46.6  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.86 
 
 
433 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.79 
 
 
587 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.94 
 
 
379 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  31.17 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.55 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  44.9 
 
 
540 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.71 
 
 
245 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.07 
 
 
77 aa  43.9  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.31 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  40.74 
 
 
239 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.71 
 
 
508 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  38.1 
 
 
381 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0912  periplasmic protease  31.65 
 
 
482 aa  43.9  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173688 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19610  negative regulator of beta-lactamase expression  36.99 
 
 
248 aa  43.5  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611508 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18110  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  44.64 
 
 
279 aa  43.1  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459182  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  46 
 
 
419 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.88 
 
 
283 aa  43.1  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  46 
 
 
417 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.29 
 
 
307 aa  42.7  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0134  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.68 
 
 
450 aa  42.7  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  38.71 
 
 
228 aa  42.7  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  36 
 
 
259 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  42 
 
 
305 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>