30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0306 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  771    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5941  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  53.69 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.86 
 
 		 410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.89 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.55 
 
 		 408 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25300  membrane-fusion protein  38.07 
 
 		 379 aa  162  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4070  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.22 
 
 		 358 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0582  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.43 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.02 
 
 		 605 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13610  hypothetical protein  37.3 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.470397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  38.66 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  39.81 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 580 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 587 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3175  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.09 
 
 		 363 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.13 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21610  hypothetical protein  31.33 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.8 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27870  hypothetical protein  42.53 
 
 		 515 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0853  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.8 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2962  hypothetical protein  40.2 
 
 		 547 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.41173  hitchhiker  0.00173595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.33 
 
 		 425 aa  53.1  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.97 
 
 		 593 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4328  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 568 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238879  normal  0.546066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1583  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.56 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474827  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3158  hypothetical protein  42.11 
 
 		 542 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.29 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2495  hypothetical protein  46.3 
 
 		 543 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  34.78 
 
 		 420 aa  43.1  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>