29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4328 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4328  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 568 aa  1092    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238879  normal  0.546066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  56.63 
 
 		 587 aa  568  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.12 
 
 		 593 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.96 
 
 		 580 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.63 
 
 		 440 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3158  hypothetical protein  33.19 
 
 		 542 aa  89.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2495  hypothetical protein  25.87 
 
 		 543 aa  88.6  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2962  hypothetical protein  36.26 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.41173  hitchhiker  0.00173595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27870  hypothetical protein  30.65 
 
 		 515 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21610  hypothetical protein  34.78 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  35.09 
 
 		 420 aa  70.1  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0027  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.84 
 
 		 367 aa  63.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.61 
 
 		 408 aa  57  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.25 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.27 
 
 		 471 aa  55.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13610  hypothetical protein  34.32 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.470397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.45 
 
 		 376 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4070  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.62 
 
 		 358 aa  54.7  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25300  membrane-fusion protein  32.49 
 
 		 379 aa  54.3  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  31.79 
 
 		 401 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.62 
 
 		 605 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  38.96 
 
 		 335 aa  49.7  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5941  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.38 
 
 		 381 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  25.95 
 
 		 391 aa  48.5  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0373  hypothetical protein  29.09 
 
 		 454 aa  48.5  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.417823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2217  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.9 
 
 		 356 aa  47.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6183  1 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  52.63 
 
 		 283 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4057  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  50 
 
 		 288 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.100978  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  29.17 
 
 		 371 aa  43.9  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>